舉例分享對(duì)黑膠蟲(chóng)樣本進(jìn)行DNA測(cè)序鑒定其為細(xì)菌的依據(jù)

黑膠蟲(chóng)污染是一個(gè)老生常談的話題。目前，科研界對(duì)黑膠蟲(chóng)的污染特征沒(méi)有統(tǒng)一的判定標(biāo)準(zhǔn)，通常污染特征總結(jié)有：

1）活躍游動(dòng)、旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)或原地顫動(dòng)
2）呈桿狀、球狀、卵圓狀；

3）培養(yǎng)基不渾濁；

4）復(fù)蘇或傳代時(shí)往往會(huì)出現(xiàn)黑膠蟲(chóng)污染，并且與細(xì)胞呈現(xiàn)此消彼長(zhǎng)的現(xiàn)象。
 

我們對(duì)多個(gè)黑膠蟲(chóng)樣本進(jìn)行測(cè)序鑒定，這里舉兩個(gè)典型鑒定結(jié)果給大家分享：

圖1 Sphingomonas（鞘氨醇單胞菌）單個(gè)及菌落圖
 

圖2 Brevundimonas vesicularis（泡囊假單胞菌）單個(gè)及菌落圖
 

這些黑膠蟲(chóng)樣本被鑒定為細(xì)菌。另外我們也查閱了大批文獻(xiàn)，十幾年前就有人做了相關(guān)研究，很多都鑒定為細(xì)菌，例如以下這篇[1]：

圖3 客戶文獻(xiàn)截圖

這篇文章講述的是，首先從黑膠蟲(chóng)污染細(xì)胞樣本中分離得到黑膠蟲(chóng)，然后從黑膠蟲(chóng)中提取基因組DNA進(jìn)行基因測(cè)序及分析，鑒定出的黑膠蟲(chóng)為無(wú)色桿菌屬(Achromobacter)。
 

細(xì)菌已經(jīng)在地球上存在三十多萬(wàn)年了，具有不同的形狀，根據(jù)形狀主要分為三類，即：球菌、桿菌和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺桿菌）（圖4）。鞭毛是著生在細(xì)菌表面的絲狀運(yùn)動(dòng)器官。由于鞭毛很細(xì)，只有用特殊的染色法，才能用光學(xué)顯微鏡觀察到。直徑12～25nm，長(zhǎng)3～12μm，柔軟、波形（圖5）。

圖4 細(xì)菌模式圖和細(xì)菌形狀分類

圖5 細(xì)菌鞭毛分布圖

單生（一根鞭毛著生于一端） 雙生（兩根鞭毛分別著生于兩端） 單叢生（一叢鞭毛著生于一端） 雙叢生（兩叢鞭毛分別著生于兩端） 周生（多根鞭毛遍布于菌體上）

鞭毛有三種運(yùn)動(dòng)方式：在液體中泳動(dòng)，在固體表面上滑行，在液體中旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)。所以難怪，我們看到的黑膠蟲(chóng)不是在液體中活躍游動(dòng)，就是在液體中旋轉(zhuǎn)梭動(dòng)，這就和黑膠蟲(chóng)被鑒定為細(xì)菌的結(jié)果相吻合了。