定量蛋白質(zhì)組表達(dá)譜分析技術(shù)---iTRAQ/TMT

iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags)技術(shù)是分別由美國AB Sciex公司和Thermo公司研發(fā)的多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這兩種技術(shù)采用2-10種穩(wěn)定同位素標(biāo)簽，通過特異性 標(biāo)記多肽的氨基基團(tuán)，然后進(jìn)行串聯(lián)質(zhì)譜分析，可同時(shí)比較多達(dá)10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)含量。

iTRAQ/TMT試劑由三部分組成：報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)。反應(yīng)基團(tuán)形成2-10種等質(zhì)量同位素標(biāo)簽。iTRAQ/TMT試劑標(biāo)記酶解后的肽段，可與氨基酸N端及側(cè)鏈的伯胺基團(tuán)發(fā)生反應(yīng)。在一級(jí)譜圖中，來自于不同樣本的同一肽段，標(biāo)記后表現(xiàn)為相同的質(zhì)荷比。在二級(jí)譜圖中，報(bào)告基團(tuán)、平衡基團(tuán)和反應(yīng)基團(tuán)之間的鍵斷裂，帶不同同位素標(biāo)簽的同一肽段產(chǎn)生質(zhì)量不同的報(bào)告離子，根據(jù)報(bào)告離子的豐度可獲得樣本間相同肽段的定量信息，再經(jīng)過軟件處理得到蛋白質(zhì)的定量信息。其基本原理與技術(shù)流程如下圖所示：

    Thermo Scientific Q Exactive/Thermo Scientific Q Exactive Plus/Thermo Scientific Orbitrap Fusion

    平行比較2-10個(gè)樣本；蛋白通量高，覆蓋度高；可用于各種類型生物樣本。

    各種脅迫、生理、病理?xiàng)l件下細(xì)胞、組織樣品中高通量蛋白表達(dá)譜分析

    各種物種的蛋白質(zhì)組草圖的構(gòu)建

參考文獻(xiàn)

[1]Yang QS, Wu JH, et al. Quantitative proteomic analysis reveals that antioxidation mechanisms contribute to cold tolerance in plantain (Musa paradisiacal L.; ABB Group) seedlings. Mol Cell Proteomics. 2012; 11(12): 1853-69.

[2]Leivonen SK, Rokka A, et al. Identification of miR-193b targets in breast cancer cell and systems biological analysis of their functional impact. Mol Cell Proteomics.2011; 10(7).

[3]Xu C, Gao X, et al. The basal level ethylene response is important to the wall and endomembrane structure in the hypocotyl cells of etiolated arabidopsis seedlings. Mol Cell Proteomics. 2012; 54(7): 434-55.

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