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接二連三,看大牛如何做有望實現(xiàn)臨床轉(zhuǎn)化的大隊列研究

瀏覽次數(shù):4383 發(fā)布日期:2019-4-29 
 代謝組學(xué)技術(shù)的興起加快了生物標志物的篩選工作,每年都有大量的文獻發(fā)表。很遺憾的是絕大數(shù)文章的研究隊列小規(guī)模較小,只是屬于前瞻性的研究,離真正走入臨床應(yīng)用還有很長一段距離。

小編注意到國內(nèi)在肝癌、冠心病、結(jié)直腸癌等領(lǐng)域已經(jīng)有了多篇大規(guī)模的報道,其中中國藥科大學(xué)臨床代謝組學(xué)中心主任齊煉文教授一直走的是大隊列研究路線。投入大量時間、金錢的背后動機,無外乎是希望實現(xiàn)科研到臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化。小編今天想跟給位老師介紹齊煉文教授團隊接二連三發(fā)表的幾篇大隊列研究。

2016年,中國藥科大學(xué)臨床代謝組學(xué)中心主任齊煉文教授等人在國際心血管領(lǐng)域頂級期刊Journal of the American College of Cardiology發(fā)表文章《Comprehensive Metabolomic Characterization of Coronary ArteryDiseases》。原文鏈接:http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-ZJJJ201604042.htm

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研究團隊利用UPLC-Q/TOF-MS對2324份血漿臨床樣本進行了非靶向代謝組學(xué)分析,鑒定到89個與冠心病發(fā)生發(fā)展表型特征密切相關(guān)的差異代謝物,其中包括磷脂相關(guān)代謝通路抑制、氨基酸代謝增強、;鈮A類代謝通路激活、膽汁酸代謝減弱等多種代謝紊亂特征。

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進一步從差異代謝物庫中篩選出12組靈敏度高(>85%)、專屬性強(>85%)的代謝標志物群,繪制了冠心病及其在不同臨床階段(冠脈硬化癥、穩(wěn)定型心絞痛、不穩(wěn)定型心絞痛、心肌梗死)的血漿代謝組學(xué)特征譜。ROC分析顯示,12組代謝標志物群診斷能力良好。

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在16年文章的基礎(chǔ)上,2017年齊煉文教授等人在心血管領(lǐng)域頂級期刊Circulation上發(fā)表文章《Functional Metabolomics Characterizes a Key Role for N-Acetyl-neuraminic Acid in Coronary Artery Diseases》。原文鏈接:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29212895

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在16年研究的基礎(chǔ)上,研究人員發(fā)現(xiàn)36種代謝物與冠心病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),隨后通過靶向代謝進一步證實N-乙酰神經(jīng)氨酸(Neu5Ac) 在血漿中的水平與冠心病事件呈顯著正相關(guān),為冠心病進展相關(guān)的代謝標志物。

研究人員發(fā)現(xiàn)N-乙酰神經(jīng)氨酸(Neu5Ac)作為信號分子,可選擇性結(jié)合Rho家族中的RhoA和Cdc42,激活Rho-ROCK信號通路誘發(fā)心肌損傷。后續(xù)分子、細胞和動物水平的深入探索,發(fā)現(xiàn)抑制N-乙酰神經(jīng)氨酸上游調(diào)控蛋白神經(jīng)氨酸酶,可以有效緩解心肌缺陷所導(dǎo)致的心肌細胞損傷。這一結(jié)果為冠心病藥物研發(fā)提供了新的靶點,也為早已上市的神經(jīng)氨酸酶抑制劑奧塞米韋和扎那米韋的藥物再定位開拓了新思路。

近日,齊煉文教授等人在胃腸肝病學(xué)領(lǐng)域頂級期刊Gastroenterology上發(fā)表文章《Tyrosine and Glutamine–leucine are Metabolic Markers of Early-stage Colorectal Cancers》。

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齊煉文教授等人對健康人、代謝綜合征患者(MS)以及結(jié)直腸癌患者(CRC)三組共3482例血清樣本進行了代謝組學(xué)檢測。

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首先研究團隊對篩選隊列的360例樣本進行了非靶向代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)30種組間顯著變化的差異代謝物。隨后對驗證隊列的1594例樣本進行非靶向代謝組學(xué)分析,7種代謝物得到進一步的驗證,并被初步篩選為潛在生物標志物;诰性回歸分析的結(jié)果表明Glu-Leu和酪氨酸具有良好的結(jié)直腸癌診斷能力,并選取驗證隊列中的900例樣本進行靶向檢測驗證。最后又繼續(xù)對預(yù)測隊列的1528例樣本進行了靶向檢測,進一步評價panel的診斷能力,結(jié)果表明Glu-Leu和酪氨酸對健康人 vs 結(jié)直腸癌患者(CRC)、代謝綜合征患者(MS) vs 結(jié)直腸癌患者(CRC)的診斷能力良好,可作為結(jié)直腸癌的早期診斷生物標志物。

研究團隊利用UPLC-Q/TOF-MS對2324份血漿臨床樣本進行了非靶向代謝組學(xué)分析,鑒定到89個與冠心病發(fā)生發(fā)展表型特征密切相關(guān)的差異代謝物,其中包括磷脂相關(guān)代謝通路抑制、氨基酸代謝增強、;鈮A類代謝通路激活、膽汁酸代謝減弱等多種代謝紊亂特征。

小編心得

1.   真正有望走向臨床應(yīng)用的代謝標志物一定是上千例的大隊列研究,投入與產(chǎn)出成正比。

中科新生命(APT)可以給客戶提供基于非靶向代謝組學(xué)的代謝標志物篩選,或基于DIA的蛋白標志物篩選的解決方案,并且曾經(jīng)參與過一項標志物篩選方向的精準醫(yī)療研究,項目經(jīng)驗豐富,頗有心得,歡迎感興趣的老師前來咨詢。

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APT的產(chǎn)品優(yōu)勢:

對于這種上百例、上千例的大樣本檢測,采集時間長,APT采用的是不同于小樣本檢測的一套特殊的數(shù)據(jù)采集模式,并且時刻監(jiān)控整個實驗過程的儀器狀態(tài)。

非靶代謝:2700+基于標品的代謝物二級譜圖數(shù)據(jù)庫+人工二次確認,雙重保證定性結(jié)果的可靠性。在不久的將來,APT還會推出MetDNA技術(shù)(放一下之前軟文的鏈接),鑒定的代謝物數(shù)量也會大大提升。

DIA:最新推出成熟的DIA服務(wù),目前2000多個樣本已經(jīng)下機,尤其是血漿樣本,無須去除高豐度,無須分級,上機2h,單個樣本可獲得1000+蛋白,也是大隊列標志物篩選、分子分型研究的首選技術(shù)。

APT質(zhì)控體系:

對于非靶向代謝組學(xué)和DIA等產(chǎn)品,中科新生命采用更高標準的質(zhì)控體系,多項評價內(nèi)容全面客觀的監(jiān)測儀器的系統(tǒng)穩(wěn)定性,評價數(shù)據(jù)質(zhì)量好壞。

APT實驗室資質(zhì)優(yōu)勢:

中科新生命有嚴格的實驗管理系統(tǒng),并且通過CMA認證、ISO9001質(zhì)量管理體系認證、室間質(zhì)評,是值得放心的選擇。

來源:上海中科新生命生物科技有限公司
聯(lián)系電話:021-54665263
E-mail:marketing@aptbiotech.com

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