新型腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)利器之cfDNA甲基化測(cè)序（cfDNA-RBS）介紹

瀏覽次數(shù)：850　發(fā)布日期：2023-3-30　來源：本站　僅供參考，謝絕轉(zhuǎn)載，否則責(zé)任自負(fù)

游離DNA（Circulating free DNA，cfDNA），是人體組織釋放到血液等循環(huán)體系中的降解的DNA片段，是一種新型的腫瘤分子標(biāo)志物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指來源于腫瘤細(xì)胞的cfDNA，ctDNA甲基化是重要的表觀學(xué)修飾之一，可以在不改變基因序列的情況下，改變遺傳表現(xiàn)，從而控制基因的表達(dá)�；蚣谆l(fā)生是癌癥發(fā)生的重要機(jī)制，相當(dāng)于調(diào)控基因表達(dá)的“開關(guān)”，其穩(wěn)定性和一致性較好，因此ctDNA甲基化是癌癥腫瘤標(biāo)志物篩查的理想手段。

腫瘤的組織起源決定了其組織特異性的DNA甲基化模式：
（1）血漿中cfDNA包含來自機(jī)體各個(gè)組織器官凋亡細(xì)胞釋放的DNA。
（2）腫瘤細(xì)胞釋放的cfDNA比正常組織細(xì)胞更高。

腫瘤的表觀遺傳標(biāo)志物

一、cfDNA甲基化檢測(cè)技術(shù)瓶頸：
對(duì)于cfDNA等相對(duì)微量且片段化十分嚴(yán)重的樣本，常用甲基化檢測(cè)主要包括cfMeDIP，微量WGBS技術(shù)。應(yīng)用RRBS檢測(cè)的CG位點(diǎn)極為有限，主要原因cfDNA自身就在選擇片段范圍之內(nèi)，如果片段內(nèi)CG含量高被酶切，反而更短不被富集，因此可能檢測(cè)到的都是CG含量低的區(qū)域片段。

追蹤腫瘤的DNA甲基化模式

二、易基因cfDNA-RBS亮點(diǎn)：
為助力低樣本量多維度分析，易基因開發(fā)了富集覆蓋CpG島、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、CTCF結(jié)合位點(diǎn)的cfDNA甲基化測(cè)序方法——cfDNA-RBS，實(shí)現(xiàn)了高靈敏度和樣本復(fù)用，使其具有高度可擴(kuò)展性，并適用于有限的樣本和單個(gè)細(xì)胞。
易基因建立的cfDNA-RBS技術(shù)，僅需10-15G測(cè)序數(shù)據(jù)，DNA建庫起始量低至5ng的cfDNA樣本，可以檢測(cè)到的5X位點(diǎn)高達(dá)4M以上，是目前腫瘤甲基化標(biāo)志物檢測(cè)研究的優(yōu)選技術(shù)，應(yīng)用場(chǎng)景包括腫瘤早篩、腫瘤診斷、個(gè)性化用藥、實(shí)時(shí)監(jiān)控、預(yù)后監(jiān)測(cè)等。

癌前病變的癌變預(yù)警標(biāo)志物檢測(cè)
腫瘤早期篩查標(biāo)志物檢測(cè)
腫瘤預(yù)后標(biāo)志物檢測(cè)
藥物療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物檢測(cè)

WGBS、cfDNA-RBS、RRBS技術(shù)位點(diǎn)覆蓋對(duì)比

三、技術(shù)優(yōu)勢(shì)：
易基因科技在DNA甲基化修飾等表觀遺傳檢測(cè)領(lǐng)域，積累了一系列國際先進(jìn)技術(shù)，可對(duì)高通量DNA甲基化組學(xué)研究，包括單細(xì)胞、微量和常量DNA甲基化測(cè)序，ctDNA、FFPE等嚴(yán)重降解痕量DNA甲基化檢測(cè)等，提供多種有效解決方案。低成本、高通量的DNA甲基化組學(xué)測(cè)序技術(shù)建立，將為研究者對(duì)不同時(shí)間和空間的表觀修飾研究奠定基礎(chǔ)。
1）微量細(xì)胞或單細(xì)胞全基因組甲基化測(cè)序（Micro DNA-WGBS）DNA起始量：
     單細(xì)胞/100-1000個(gè)細(xì)胞
     1ng基因組DNA
     90%以上基因組CG覆蓋
2）微量細(xì)胞或DNA簡化基因組甲基化測(cè)序（Micro DNA-RRBS）DNA起始量：
     1ng基因組DNA；
     10-20M有效CG位點(diǎn)覆蓋；
     10-20G測(cè)序數(shù)據(jù)量；
3）微量cfDNA簡化基因組甲基化測(cè)序（cfDNA-RBS）
     100ul血漿或1ng cfDNA
     10M有效CG位點(diǎn)覆蓋
     15-20G測(cè)序數(shù)據(jù)量

四、cfDNA-RBS信息分析
易基因建立的cfDNA-RBS技術(shù)，可基于CpG島、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、CTCF結(jié)合位點(diǎn)等區(qū)域，實(shí)現(xiàn)單堿基分辨率的甲基化位點(diǎn)精準(zhǔn)定位，快速準(zhǔn)確地找到差異位點(diǎn)，實(shí)現(xiàn)高效分析DMR及相關(guān)基因的功能分析。

五、不同DNA甲基化檢測(cè)技術(shù)指標(biāo)比較

不同DNA甲基化檢測(cè)技術(shù)CG位點(diǎn)比較

六、cfDNA甲基化臨床研究技術(shù)選擇推薦

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標(biāo)簽： cfDNA 游離DNA 甲基化測(cè)序

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