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文獻解讀:轉(zhuǎn)錄因子JUN介導(dǎo)的seRNA形成R環(huán)促進鼻咽癌轉(zhuǎn)移

瀏覽次數(shù):856 發(fā)布日期:2024-1-30  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

近日,湖南省腫瘤醫(yī)院唐發(fā)清研究團隊在鼻咽癌轉(zhuǎn)移分子機制取得了新進展,相關(guān)研究成果已經(jīng)發(fā)表在國際權(quán)威期刊《Cell Death & Disease》(IF=9.0、一區(qū)top期刊)上。

增強子是DNA遠(yuǎn)端元件,在細(xì)胞類型特異性生物過程中可激活或增加相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。 轉(zhuǎn)錄因子 (TF) 通過特殊的識別序列與這些增強子結(jié)合,并與輔助因子合作,在增強子和啟動子之間形成染色質(zhì)環(huán)。據(jù)報道,超級增強子(SEs)是一系列增強子,也被稱為伸展增強子,存在于對細(xì)胞存活和腫瘤發(fā)生至關(guān)重要的基因附近,通過激活鄰近基因促進致癌過程。增強子(SEs)連接若干啟動子,通常與其目標(biāo)基因相距數(shù)百個干堿基。與典型的增強子(TEs)相比,增強子含有更大的開放染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域,其特征是高水平的H3K27乙酰化(H3K27ac),并富集用于TEs結(jié)合。SEs通常與RNA聚合酶II(RNAPII)結(jié)合,產(chǎn)生被稱為seRNA的雙向非編碼RNA。seRNAs或類似seRNA的非編碼RNAs的缺失會導(dǎo)致與之相關(guān)的蛋自編碼基因下調(diào), seRNAs在腫瘤發(fā)生中發(fā)揮著重要作用。

鼻咽癌(NPC)是一種起源于異咽部、具有高度轉(zhuǎn)移潛力的惡性腫瘤。雖然鼻咽癌對放療敏感,但遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移患者的預(yù)后仍然很差。 1,4-二硝基哌嗪((DNP)是腌制食品中最主要的揮發(fā)性亞硝胺。一些研究表明,DNP可以在體內(nèi)促進NPC癌變和轉(zhuǎn)移。

在本研究中,證明了一種新的鼻咽癌轉(zhuǎn)移分子機制。采用全局run-on測序、染色質(zhì)免疫沉淀測序和 RNA測序相結(jié)合的方法篩選 seRNA一個與異咽癌轉(zhuǎn)移相關(guān)的特異seRNA (seRNA-NPCM)被鑒定為N-myc下游調(diào)控基因1(NDRG1)的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子。已證實主轉(zhuǎn)錄因子JUN對激活seRNA-NPCM的產(chǎn)生至關(guān)重要。從基因間區(qū)轉(zhuǎn)錄的seRNA-NPCM可促進鼻咽癌的體外和體內(nèi)轉(zhuǎn)移。在鼻咽癌患者中,seRNA-NPCM 的表達(dá)預(yù)示病情不佳。SeRNA-NPCM在SE區(qū)域形成RNA-DNA環(huán)(R-loops),并與 NDRG1和 TRIB1 啟動子上的 hnRNPR結(jié)合,從而促進增強子-啟動子環(huán)形成和基因轉(zhuǎn)錄。seRNA-NPCM還與 ACTA1 直接相互作用。 這些發(fā)現(xiàn)對于闡明 seRNA-NPCM 在鼻咽瘤轉(zhuǎn)移過程中調(diào)節(jié)啟動子的分子機制具有重要意義。

 
seRNA-NPCM通過R環(huán)形成調(diào)節(jié)NDRG1和TRIB1的表達(dá)模型示意圖

為了證實seRNA-NPCM對于鼻咽癌的體內(nèi)轉(zhuǎn)移的影響,作者使用了廣州博鷺騰生物科技有限公司的AniView系列多模式動物活體成像系統(tǒng)拍攝了鼻咽癌腫瘤的轉(zhuǎn)移過程,結(jié)果顯示seRNA-NPCM的表達(dá)能顯著增強體內(nèi)鼻咽癌的轉(zhuǎn)移。
 
基于熒光素酶的生物發(fā)光成像對裸鼠鼻咽癌轉(zhuǎn)移性狀態(tài)的體內(nèi)成像。
黃色箭頭:轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)
 
論文鏈接:http://doi.org/10.1038/s41419-023-05985-9
來源:廣州博鷺騰生物科技有限公司
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