Ribo-seq檢測(cè)正在翻譯的mRNA信息，連接轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)

技術(shù)原理 技術(shù)特點(diǎn) 應(yīng)用方向 藍(lán)景科信優(yōu)勢(shì)
實(shí)驗(yàn)周期快、質(zhì)量高、結(jié)果穩(wěn)定可靠。
豐富的物種經(jīng)驗(yàn)。
實(shí)驗(yàn)流程 分析內(nèi)容
標(biāo)準(zhǔn)生信分析
（1）原始數(shù)據(jù)過(guò)濾與測(cè)序質(zhì)量評(píng)估
（2）比對(duì)去除核糖體RNA、tRNA、sRNA等
（3）Reads長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì)與長(zhǎng)度過(guò)濾
（4）比對(duì)參考基因組
（5）測(cè)序飽和度分析
（6）RF在基因組上的分布統(tǒng)計(jì)與分類(lèi)
（7）三堿基節(jié)律分析
（8）翻譯基因統(tǒng)計(jì)與表達(dá)量分析
（9）樣本關(guān)系分析
（10）組間差異翻譯基因分析
（11）差異翻譯基因的GO和KEGG功能富集分析
Ribo-seq與RNA-seq的聯(lián)合分析
（1）翻譯效率計(jì)算
（2）翻譯效率與轉(zhuǎn)錄水平的關(guān)系分析
（3）翻譯效率與轉(zhuǎn)錄水平的關(guān)聯(lián)分析
分析流程 實(shí)驗(yàn)案例 送樣要求
（1）細(xì)胞樣本：建議送樣量5×10⁶-1×10⁷個(gè)。
（2）動(dòng)物組織樣本：建議送樣量≥300 mg。
（3）植物組織樣本：建議送樣量≥500 mg。
樣本分組
至少2組樣品，包括對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組，樣本數(shù)建議：3 Vs 3。
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