高通量測序服務(wù)——宏基因組學(xué)研究

美吉擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術(shù)平臺，可以根據(jù)合作伙伴要求靈活安排實驗，實驗周期短，質(zhì)量可靠。

服務(wù)類別：	測序/合成	總訪問：	2373
最后更新：	2015-7-14	半年訪問：	18
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服務(wù)商：上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡介

高通量測序服務(wù)——宏基因組學(xué)研究

詳細描述：

宏基因組學(xué)（Metagenomics）是將環(huán)境樣品中的微生物群落作為整體進行研究的學(xué)科。與傳統(tǒng)的微生物個體研究相比，宏基因組學(xué)的研究手段是直接從環(huán)境樣品中提取基因組DNA后進行測序分析。這種新的研究技術(shù)具有許多優(yōu)勢：① 自然界中，有許多微生物是不能在實驗室條件下進行培養(yǎng)繁殖的，宏基因組學(xué)研究不要求對微生物進行分離培養(yǎng)，從而大大擴展了微生物研究范圍；② 宏基因組學(xué)引入了宏觀生態(tài)的研究理念，對環(huán)境中微生物菌群的多樣性、功能活性等宏觀特征進行研究，可以更準確地反映出微生物生存的真實狀態(tài)。

采用第二代高通量測序技術(shù)進行宏基因組學(xué)研究，無需構(gòu)建克隆文庫，可以直接對環(huán)境樣品中的基因組片段進行測序，這避免了文庫構(gòu)建過程中利用宿主菌對樣品進行克隆而引起的系統(tǒng)偏差，簡化了宏基因組研究的基本操作,提高了測序效率,從而極大地促進了宏基因組學(xué)的發(fā)展。

美吉優(yōu)勢

1. 擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術(shù)平臺，可以根據(jù)合作伙伴要求靈活安排實驗，實驗周期短，質(zhì)量可靠。

2. 擁有Roche 454和Illumina Solexa兩種高通量測序平臺，合作伙伴可根據(jù)具體需求進行選擇，以獲取最佳的實驗結(jié)果。

3. 技術(shù)人員經(jīng)驗豐富，可以根據(jù)合作伙伴要求在第一時間提供實驗方案、解決實驗問題、分析實驗結(jié)果。

4. 擁有專業(yè)的生物信息團隊和大型計算機，可以為合作伙伴提供個性化的生物信息分析服務(wù)。

生物信息分析

1. 物種鑒定

將所得序列（通常為16S/18S rRNA等兼具保守及高變特性的序列）與專業(yè)數(shù)據(jù)庫（Silva、RDP等）進行比對，得出樣品中所含物種的信息。

2. 多樣性統(tǒng)計學(xué)分析

將所得序列（通常為16S/18S rRNA等兼具有保守及高變特性的序列）進行聚類，得到相應(yīng)的OTUs（分類操作單元）。通過統(tǒng)計學(xué)手段，分析出環(huán)境樣品中的主要成分及不同樣品間的明顯差異因素。結(jié)合物種鑒定，可以得到關(guān)鍵菌群。

3. 宏基因組拼接

對環(huán)境樣品DNA進行大規(guī)模測序后，通過嚴格的拼接方式，可獲得較長的DNA片段。當樣品的生物多樣性較低，且達到一定測序通量后，很有可能直接獲得一個或多個微生物基因組草圖。

4. 功能分析

將所得序列與已有的數(shù)據(jù)庫進行比對，進行基因功能的注釋。其中，常用的數(shù)據(jù)庫包括NT、NR、GO、COG、KEGG、SEED、Swiss-Prot等。

5. 微生物群落結(jié)構(gòu)及功能

通過大量測序，可以獲得樣品的群落結(jié)構(gòu)信息，如微生物物種在該環(huán)境下的分布情況及成員間協(xié)作關(guān)系等。通過實驗還可以確定一些特殊的主要基因或DNA片段。對于多個樣品，還可做相應(yīng)的比較分析，發(fā)掘樣品間的相同點與不同點。

成功案例

目前，美吉生物已經(jīng)承擔了多個國內(nèi)知名院校的宏基因組項目的測序和分析工作，領(lǐng)域涉及土壤、水樣（海洋、湖泊、魚塘）、污泥、發(fā)酵罐、生物膜、葉子表面、腸道、瘤胃、口腔等環(huán)境樣品中的微生物。利用Roche 454和Illumina Solexa 高通量測序平臺，美吉生物積累了大量的案例分析經(jīng)驗，并建立了一套完整的宏基因組分析流程。

上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司專注于新一代DNA高通量測序技術(shù)的應(yīng)用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發(fā)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究，是上海張江高科技園區(qū)、張江藥谷重點支持企業(yè)，華東師范大學(xué)戰(zhàn)略合作單位。目前，美吉生物在上海、北京、廣州三個一線城市建立了實驗基地，銷售網(wǎng)絡(luò)遍布全國各地。

美吉生物擁有世界一流的測序平臺，在ABI3730xl常規(guī)測序平臺的基礎(chǔ)上，先后引進了羅氏454高通量測序平臺和Illumina高通量測序平臺，專業(yè)提供動植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、小RNA測序、基因表達譜分析等技術(shù)服務(wù)。

美吉生物擁有一支實力雄厚的技術(shù)團隊，有從事分子生物學(xué)研究十多年、經(jīng)驗豐富的技術(shù)骨干，也有創(chuàng)新進取、拼勁十足的希望之星。技術(shù)團隊經(jīng)驗豐富，曾參與水稻、番茄、家蠶等多項大型基因組學(xué)項目，可以為您提供專業(yè)、合理、高性價比的實驗方案。

生物信息學(xué)是國際前沿的新興學(xué)科，近年來發(fā)展迅猛。美吉生物擁有一支具有國際一流水平的生物信息分析團隊，不僅可以提供標準流程化的生物信息分析，還可以根據(jù)不同的課題需求，提供個性化的深度數(shù)據(jù)挖掘。

B2B(Bench to Bedside)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)模式，大大縮短了醫(yī)學(xué)科學(xué)從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的時間，加速了人類進入基因組醫(yī)學(xué)時代的步伐�；趯ξ磥磲t(yī)學(xué)發(fā)展趨勢的充分理解，美吉生物和國內(nèi)多家著名三甲醫(yī)院聯(lián)合建立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心，開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究，以迎接基因組醫(yī)學(xué)時代的到來。

美吉生物秉承“專業(yè)、卓越”的企業(yè)理念，“以客戶為本，讓客戶滿意”的服務(wù)宗旨，一如既往地致力于提供高品質(zhì)、高效率的技術(shù)服務(wù)，努力將公司打造成為國內(nèi)一流企業(yè)。因為敬業(yè)，所以專業(yè)；因為專業(yè)，所以選擇；選擇美吉，選擇滿意！

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