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microRNA(miRNA)測(cè)序服務(wù)

microRNA(miRNA)測(cè)序服務(wù)


microRNA(miRNA) Sequencing Service
康成生物以Illumina Genome Analyzer IIx為技術(shù)平臺(tái),提供microRNA測(cè)序服務(wù)。高通量測(cè)序技術(shù)具備數(shù)字化信號(hào)、任意物種的高通量分析、高靈敏度、高質(zhì)量數(shù)據(jù)、高置信度等優(yōu)勢(shì)。
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問:4152
最后更新:2018-11-26半年訪問:39
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microRNA測(cè)序服務(wù)

     microRNA是一類大小為21-23nt的非編碼小RNA分子,通過沉默或降解其靶點(diǎn)mRNA分子調(diào)控基因表達(dá)。大量研究表明,microRNA在正常發(fā)育過程以及疾病發(fā)生過程中具有重要的作用,在診斷和治療領(lǐng)域具有光明的應(yīng)用前景。然而目前研究microRNA的方法主要是通過實(shí)時(shí)定量PCR以及基因芯片技術(shù),這些方法主要關(guān)注microRNA的表達(dá)與定量,并僅局限于研究那些序列信息或二級(jí)莖環(huán)結(jié)構(gòu)信息已知的microRNA,無法尋找和發(fā)現(xiàn)新的microRNA分子。
     基于Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)的microRNA測(cè)序技術(shù)突破了目前研究技術(shù)手段上的局限性,不但可以檢測(cè)microRNA表達(dá)差異,而且可以研究microRNA的3’異質(zhì)性,眾多的isomiR(microRNA異構(gòu)體),以及未發(fā)現(xiàn)的新的microRNA,為更加靈活、深入研究microRNA提供解決方案。

 

康成生物為您提供microRNA測(cè)序技術(shù)服務(wù),您只需要提供保存完好的組織或細(xì)胞標(biāo)本,康成的技術(shù)服務(wù)人員就可為您完成全部實(shí)驗(yàn)操作,包括RNA抽提、小RNA文庫(kù)構(gòu)建和純化、高通量測(cè)序和數(shù)據(jù)分析、并提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告。

 

microRNA測(cè)序技術(shù)優(yōu)勢(shì)
* 適用于所有物種的microRNA表達(dá)譜分析——無需預(yù)知microRNA的序列和二級(jí)結(jié)構(gòu)信息
全基因組范圍的表達(dá)譜分析——涵蓋了任意長(zhǎng)度的,已知和未知的microRNA
數(shù)字化信號(hào)——測(cè)序直接獲得序列,可鑒別序列間單個(gè)堿基的差異,識(shí)別microRNA變體;
檢測(cè)范圍寬——跨越5個(gè)數(shù)量級(jí)的寬檢測(cè)閾值,從幾個(gè)到數(shù)十萬個(gè)拷貝精確計(jì)數(shù);
靈敏度高——每個(gè)獨(dú)立的測(cè)序通道可以檢測(cè)多達(dá)1000萬轉(zhuǎn)錄組分子序列,提供了極大的數(shù)據(jù)深度與覆蓋率,能夠檢測(cè)豐度極低的,以及稀少的microRNA。
數(shù)據(jù)質(zhì)量高——microRNA測(cè)序具有極大的測(cè)序通量,靈敏度與精確性,同時(shí)其產(chǎn)生的定量數(shù)據(jù)與實(shí)時(shí)定量PCR結(jié)果具有很高的一致性。
生物信息分析更豐富——能夠隨時(shí)使用最新的microRNA數(shù)據(jù)庫(kù)注釋原始數(shù)據(jù)中已知的microRNA,還能夠進(jìn)一步發(fā)掘未匹配數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)新的microRNA種類及異構(gòu)體,尋找更深入的研究信息。

 

 

康成生物microRNA測(cè)序的特點(diǎn)

1. 一站式解決方案

康成生物獨(dú)家為您提供microRNA高通量測(cè)序全程技術(shù)服務(wù),您只需要提供保存完好的組織或細(xì)胞樣本,康成的測(cè)序技術(shù)服務(wù)人員就可為您完成全部實(shí)驗(yàn)操作,并提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告。

2.  適合樣品量少的客戶

康成對(duì)測(cè)序?qū)嶒?yàn)經(jīng)過優(yōu)化,從總RNA開始實(shí)驗(yàn),不需要對(duì)MicroRNA進(jìn)行富集和反復(fù)的純化,因此對(duì)于樣品量少的客戶更加適合, 1ug就可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

3.  節(jié)省實(shí)驗(yàn)的步驟,減少實(shí)驗(yàn)誤差

傳統(tǒng)方法是先對(duì)microRNA進(jìn)行富集,再兩邊加接頭,而且每一步都要純化回收,很容易產(chǎn)生實(shí)驗(yàn)誤差,而我們只需要對(duì)總RNA就能完成實(shí)驗(yàn),減少實(shí)驗(yàn)誤差。
4. 深入的數(shù)據(jù)分析

康成生物擁有強(qiáng)大的生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì),能夠根據(jù)不同客戶的要求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)和深入的數(shù)據(jù)分析,提供能直接用于文章發(fā)表的圖表和數(shù)據(jù)。

 

康成生物提供的microRNA測(cè)序服務(wù)流程


1. 樣品RNA準(zhǔn)備
2. 測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建

   PAGE膠純化特定大小的microRNA分子
    連接5’RNA接頭
    連接3’RNA接頭
    逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)獲得cDNA測(cè)序文庫(kù)
    高保真聚合酶擴(kuò)增構(gòu)建的測(cè)序文庫(kù)
3. DNA成簇(Cluster)擴(kuò)增
4. 高通量測(cè)序(Illumina Genome Analyzer IIx)
5. 數(shù)據(jù)分析

    原始數(shù)據(jù)讀取
    使用公用microRNA數(shù)據(jù)庫(kù)注釋已知microRNA
    深層次數(shù)據(jù)分析
6. 提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告
    原始數(shù)據(jù)報(bào)告(Fasta-Q格式),包含所有測(cè)序序列信息,堿基讀取質(zhì)量評(píng)估
    基本數(shù)據(jù)分析報(bào)告(Excel表格),包含有效序列的序列信息、與參考基因組比對(duì)后的注釋信息等
    高級(jí)數(shù)據(jù)分析(應(yīng)客戶要求定制),如使用已知數(shù)據(jù)庫(kù)注釋已知microRNA及分析不同樣本間表達(dá)水平差異,使用已知數(shù)據(jù)庫(kù)鑒別rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA并預(yù)測(cè)新的microRNA,預(yù)測(cè)microRNA的靶點(diǎn)基因。

 

 

 

 

 

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