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DNA甲基化測(cè)序服務(wù)

DNA甲基化測(cè)序服務(wù)


MeDIP-Sequencing Service
康成生物提供基于Illumina Genome Analyzer IIx測(cè)序系統(tǒng)的高通量測(cè)序服務(wù)項(xiàng)目，為基因組，轉(zhuǎn)錄組以及表觀遺傳組等研究領(lǐng)域的廣大研究人員提供更深入，更全面的技術(shù)服務(wù)。
服務(wù)類(lèi)別：測(cè)序/合成總訪問(wèn)：2889
最后更新：2018-11-26半年訪問(wèn)：50
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DNA甲基化測(cè)序服務(wù)

  DNA甲基化是表觀遺傳（Epigenetics）調(diào)控的重要組成部分，在維持正常細(xì)胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類(lèi)腫瘤發(fā)生中起著重要的作用，是目前新的研究熱點(diǎn)之一。在哺乳動(dòng)物中，甲基化一般發(fā)生在CpG的胞嘧啶5位碳原子上，通過(guò)使用5’-甲基胞嘧啶抗體富集高甲基化的DNA片段，并結(jié)合Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)，對(duì)所有富集的DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序，研究人員能夠獲得全基因組范圍內(nèi)高精度的甲基化狀態(tài)，為深入的表觀遺傳調(diào)控分析提供了更有利的切入點(diǎn)。

 

康成生物為您提供甲基化測(cè)序技術(shù)服務(wù)，您只需要提供保存完好的組織或細(xì)胞標(biāo)本，康成的技術(shù)服務(wù)人員就可為您完成全部實(shí)驗(yàn)操作，包括超聲打斷基因組、甲基化DNA免疫共沉淀、MeDIP與 Input DNA文庫(kù)構(gòu)建、高通量測(cè)序和數(shù)據(jù)分析、并提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告。


DNA甲基化測(cè)序技術(shù)優(yōu)勢(shì) 
* 靈活度高：能夠直接對(duì)任意物種的高甲基化片段進(jìn)行測(cè)序，無(wú)需已知的基因組序列信息。

* 檢測(cè)范圍廣：覆蓋整個(gè)基因組范圍的甲基化區(qū)域。

* 精確度高：能夠在實(shí)際結(jié)合位點(diǎn)50個(gè)堿基范圍內(nèi)精確定位。

* 數(shù)字化信號(hào)：直接對(duì)甲基化片段進(jìn)行測(cè)序和定量，不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號(hào)帶來(lái)的交叉反應(yīng)和背景噪音問(wèn)題。


康成MeDIP-seq技術(shù)服務(wù)優(yōu)勢(shì)
＊MeDIP富集效果特異性佳：MeDIP是獲得準(zhǔn)確測(cè)序數(shù)據(jù)的關(guān)鍵。康成MeDIP平臺(tái)經(jīng)過(guò)不斷地優(yōu)化，抗體富集效率高和特異性好。

 

*圖釋?zhuān)嚎党蓛?yōu)化后的MeDIP平臺(tái)效果。橫坐標(biāo)為MeDIP-score其數(shù)值大小代表基因啟動(dòng)子甲基化水平，縱坐標(biāo)為基因的數(shù)目。左圖為用經(jīng)典MeDIP方法構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)的效果，陽(yáng)性基因H19和Xist的信號(hào)無(wú)法和陰性基因GAPDH進(jìn)行區(qū)分。右圖為優(yōu)化后的結(jié)果展示，陽(yáng)性基因的MeDIP-score值遠(yuǎn)高于陰性基因，證明抗體富集的特異性。


＊嚴(yán)格的質(zhì)控體系：康成生物在MeDIP-seq每個(gè)關(guān)鍵步驟都加入了質(zhì)控實(shí)驗(yàn)。這些QC數(shù)據(jù)能夠評(píng)估每個(gè)步驟的質(zhì)量。如果達(dá)不到標(biāo)準(zhǔn)，我們會(huì)重復(fù)實(shí)驗(yàn)步驟或者優(yōu)化實(shí)驗(yàn)體系，使得每個(gè)樣品都能夠順利進(jìn)入下個(gè)實(shí)驗(yàn)環(huán)節(jié)。

*圖釋?zhuān)?MeDIP-qPCR 質(zhì)控。測(cè)序?qū)嶒?yàn)之前先對(duì)MeDIP實(shí)驗(yàn)效果進(jìn)行評(píng)估，確定抗體富集的特異性。圖中H19的啟動(dòng)子區(qū)域?yàn)殛?yáng)性對(duì)照，管家基因GAPDH啟動(dòng)子區(qū)域?yàn)殛幮詫?duì)照，檢測(cè)結(jié)果以MeDIP樣品和Input樣品的qPCR數(shù)據(jù)的比值表示�？梢钥闯觯篗eDIP特異地富集甲基化的DNA區(qū)域，且陽(yáng)性信號(hào)遠(yuǎn)高于背景噪音。


*圖釋?zhuān)?MeDIP-seq技術(shù)服務(wù)流程和關(guān)鍵步驟的質(zhì)量控制

＊優(yōu)化的文庫(kù)制備流程: 起始量少至1μg乃至更少量的起始DNA樣品即可進(jìn)行甲基化測(cè)序?qū)嶒?yàn)；同時(shí)，對(duì)MeDIP富集過(guò)程及測(cè)序文庫(kù)嚴(yán)格的質(zhì)量監(jiān)控保證了高品質(zhì)的測(cè)序結(jié)果。


＊對(duì)DNA甲基化水平進(jìn)行數(shù)字化定量分析：通過(guò)對(duì)測(cè)序得到的大量序列進(jìn)行深入分析，MeDIP-seq得到的序列信息能夠轉(zhuǎn)換為可定量的甲基化水平信息。對(duì)基因組任意區(qū)域的甲基化水平給出定量的結(jié)果，并分析差異甲基化的區(qū)域。


＊可視化分析: 提供50bp精度的全基因組DNA甲基化信號(hào)可視化數(shù)據(jù)。通過(guò)UCSC基因組瀏覽器（UCSC genome browser），任意區(qū)域的甲基化水平能夠直觀的進(jìn)行展示和比較。

 

康成生物提供的DNA甲基化測(cè)序服務(wù)流程
1. 甲基化DNA免疫共沉淀（MeDIP）
2. 測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建
3. DNA成簇（Cluster）擴(kuò)增
4. 高通量測(cè)序
5. 數(shù)據(jù)分析
6. 提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告


 

 

 

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