腫瘤的發(fā)生往往是由于某些原癌基因(oncogenes)或者抑癌基因(tumor suppressor genes)的熱點(diǎn)區(qū)域發(fā)生了突變?焖、簡便地鑒定腫瘤相關(guān)基因熱點(diǎn)區(qū)域的突變對(duì)于腫瘤研究具有重要意義。傳統(tǒng)的設(shè)計(jì)引物、PCR擴(kuò)增、構(gòu)建測(cè)序文庫、Sanger測(cè)序的方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力,需要花費(fèi)一個(gè)星期以上的時(shí)間來完成。
利用Life technologies公司發(fā)布的最新一代Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序平臺(tái)和Ion AmpliSeqTM Cancer Hotspot Panel V2試劑盒?茖W(xué)家們能迅速對(duì)50個(gè)原癌基因和抑癌基因的207個(gè)突變頻發(fā)區(qū)域進(jìn)行檢測(cè),從構(gòu)建文庫到得到分析好的數(shù)據(jù)僅需10個(gè)小時(shí)。上海伯豪生物技術(shù)有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心是國內(nèi)基因組學(xué)領(lǐng)域技術(shù)服務(wù)的領(lǐng)軍企業(yè),為大家提供完整的腫瘤相關(guān)基因篩查服務(wù)。
一、上海伯豪Ion Torrent測(cè)序服務(wù)
Ion Torrent是最新一代的測(cè)序技術(shù),它的問世給測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用帶來了激動(dòng)人心的進(jìn)展。它采用了半導(dǎo)體技術(shù)和簡單的化學(xué)試劑進(jìn)行DNA測(cè)序,而不是使用光作為媒介。在半導(dǎo)體芯片的微孔中固定DNA鏈,隨后依次摻入ATCG。隨著每個(gè)堿基的摻入,釋放出氫離子,在它們穿過每個(gè)孔底部時(shí)能被檢測(cè)到,通過對(duì)H+的檢測(cè),實(shí)時(shí)判讀堿基。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
• 更準(zhǔn)確:系統(tǒng)無激光光源,無化學(xué)系統(tǒng),無照相系統(tǒng);使用無標(biāo)記的核苷酸及酶進(jìn)行測(cè)序,本底干擾低。通過對(duì)H+的檢測(cè),明顯改善堿基判讀準(zhǔn)確性。
• 更快速:標(biāo)準(zhǔn)測(cè)序時(shí)間僅為2-3小時(shí),24小時(shí)之內(nèi)可完成6-8輪實(shí)驗(yàn);達(dá)Sanger測(cè)序方法每天測(cè)序通量的數(shù)千倍以上;彌補(bǔ)了已有高通量測(cè)序方法“無快速測(cè)序模式”的缺陷。
• 更靈活:通量為10M,100M和1G芯片可以任意選擇。測(cè)序長度可以為35bp、100bp和200bp。
實(shí)驗(yàn)流程:
文庫制備—“油包水”PCR—半導(dǎo)體芯片測(cè)序—數(shù)據(jù)分析
技術(shù)原理:
1、脫氧核苷酸分子流過芯片微孔;
2、如果脫氧核苷酸與微孔中的DNA分子互補(bǔ),則該核苷酸被合成到DNA分子中,并且釋放氫離子,該孔溶液的PH發(fā)生變化;
3、感應(yīng)層檢測(cè)到PH變化;
4、感應(yīng)層將PH變化的化學(xué)信息轉(zhuǎn)變?yōu)殡妷鹤兓畔ⅲ?br />
5、電壓變化信息轉(zhuǎn)變?yōu)閿?shù)字電子信息。如果DNA鏈含有兩個(gè)相同的堿基,則記錄電壓信號(hào)是雙倍的。如果堿基不匹配,則無氫離子釋放,也就沒有電壓信號(hào)的變化。
二、Ion AmpliSeqTM Cancer Hotspot Panel V2服務(wù)
序列捕獲測(cè)序能對(duì)基因組上某些特定的區(qū)域進(jìn)行分析,但是傳統(tǒng)的序列捕獲測(cè)序技術(shù)操作復(fù)雜,實(shí)驗(yàn)時(shí)間長,而且對(duì)DNA樣品的數(shù)量要求較高;贗on Torrent測(cè)序儀,life technologies發(fā)布了Ion AmpliSeqTM Cancer Hotspot Panel V2試劑盒,利用這款試劑盒科學(xué)家們能夠快速完成50個(gè)腫瘤相關(guān)基因的突變篩察。
實(shí)驗(yàn)原理:
life technologies針對(duì)50個(gè)腫瘤相關(guān)基因的207個(gè)常見突變區(qū)域設(shè)計(jì)了引物,在同一個(gè)EP管中進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增。隨后純化擴(kuò)增產(chǎn)物,利用Ion Torrent進(jìn)行測(cè)序分析。
從構(gòu)建文庫到拿到分析好的數(shù)據(jù),整個(gè)過程僅需10個(gè)小時(shí)。
技術(shù)參數(shù):
技術(shù)亮點(diǎn):
1、多重:科研人員不再局限于少數(shù)幾個(gè)基因,而是能夠同時(shí)快速分析50個(gè)基因。
2、10ng DNA:樣品起始量低,使得研究人員能挑戰(zhàn)高難度樣品,例如FFPE樣品。
3、1天:整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程,從樣品到數(shù)據(jù)分析完畢僅需10小時(shí),其中建庫時(shí)間僅需3.5小時(shí)。
Ion AmpliSeqTM Cancer Hotspot Panel V2試劑盒所能分析的基因列表
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上海伯豪生物技術(shù)有限公司(簡稱:伯豪生物,英文名:Shanghai Biotechnology Corporation)2008 年 12 月成立,是生物芯片國家工程研究中心的有機(jī)組成部分,專注于提供專業(yè)的生物醫(yī)藥和疾病診斷創(chuàng)新技術(shù)、產(chǎn)品和優(yōu)質(zhì)服務(wù)。
伯豪生物自成立以來獲得了國家基因檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用示范中心、國家工信部專精特新“小巨人”企業(yè)、院士專家工作站、高新技術(shù)企業(yè)、上海市研發(fā)公共服務(wù)平臺(tái)(負(fù)責(zé)“上海市高通量疾病標(biāo)志物服務(wù)平臺(tái)”和“上海市基因芯片專業(yè)服務(wù)平臺(tái)”的運(yùn)營)、上海市服務(wù)外包公共平臺(tái)、上?萍夹【奕似髽I(yè)、浦東新區(qū)企業(yè)研發(fā)機(jī)構(gòu)、聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室建設(shè)等一系列資質(zhì),擁有醫(yī)療機(jī)構(gòu)執(zhí)業(yè)許可證、醫(yī)療器械經(jīng)營許可證。
伯豪生物于 2016 年入選國家發(fā)展和改革委員會(huì)首批基因檢測(cè)技術(shù)應(yīng)用示范中心,與復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院、上海市胸科醫(yī)院、上海市兒童醫(yī)院、上海生物信息技術(shù)研究中心等單位共同承擔(dān)運(yùn)行“高發(fā)腫瘤及遺傳性疾病基因檢測(cè)示范中心”。
伯豪生物建立了規(guī)范化的質(zhì)量控制體系,通過了 ISO9001:2015 質(zhì)量技術(shù)體系的認(rèn)證,并參照 GLP- L 的標(biāo)準(zhǔn),通過 156 個(gè) SOP 文件對(duì)項(xiàng)目、樣品、實(shí)驗(yàn)過程、生物信息分析過程、數(shù)據(jù)信息管理、保密等進(jìn)行嚴(yán)格質(zhì)控。
伯豪生物累計(jì)技術(shù)服務(wù) 10 余年,承接項(xiàng)目數(shù)超 10000 個(gè),用戶單位 3000 家以上,累計(jì)處理樣品超過 30 萬份,協(xié)助客戶發(fā)表論文 2000 余篇,總影響因子(IF)超 10000 分,平均影響因子(IF)大于 5 分。全面推動(dòng)中國基因組學(xué)服務(wù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展?煽康馁|(zhì)量已經(jīng)得到了國內(nèi)及國際科研領(lǐng)域的認(rèn)可!伯豪生物秉承著“服務(wù)科技創(chuàng)新,護(hù)航人類健康!”的使命,為每一位伯豪生物客戶提供專注、專業(yè)、高效的科研技術(shù)服務(wù)。
伯豪生物經(jīng)過十多年不斷投入和持續(xù)打造,伯豪生物已經(jīng)成長為一家硬件精良,人才合理,技術(shù)專業(yè),管理規(guī)范,理念先進(jìn),符合國際標(biāo)準(zhǔn)的以技術(shù)開發(fā)和技術(shù)服務(wù)見長的生物技術(shù)公司。
經(jīng)營范圍
生物芯片、實(shí)驗(yàn)室試劑及相關(guān)設(shè)備的研發(fā)、生產(chǎn)、銷售,生物醫(yī)藥技術(shù)專業(yè)領(lǐng)域的技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,從事貨物與技術(shù)的進(jìn)出口。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)】。
時(shí)空組學(xué) |
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基因組 |
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轉(zhuǎn)錄組 |
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表觀組 |
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蛋白質(zhì)組學(xué) |
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生信分析 |
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儀器試劑耗材 |
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