動(dòng)植物基因組重測序

推薦平臺(tái)：Illumina HiSeq 2000、Illumina MiSeq

1、 DNA樣品：濃度≥100 ng/μl，總量≥50 μg，OD260/280值應(yīng)在1.8-2.0之間，電泳檢測無明顯RNA條帶，基因組條帶清晰、完整，主帶應(yīng)在100 kb以上。若樣品中有多糖、糖蛋白的殘留， 對(duì)打斷DNA樣品帶來非常大的困難，且很難去除，因此特別要求所提供的樣品一定要將多糖或糖蛋白去除干凈。
  

2、 動(dòng)物樣品：對(duì)于一般物種應(yīng)挑選肝臟、腎臟、血液等組織取樣，對(duì)于珍貴物種請?zhí)峁┒鷺�、毛發(fā)（帶毛根）等脂肪含量較少的組織進(jìn)行取樣。為了減少個(gè)體差異對(duì)后續(xù)拼接產(chǎn)生的影響，盡量從同一個(gè)個(gè)體中取樣。若物種體積較小，從一個(gè)個(gè)體中提取的DNA量不能滿足測序?qū)嶒?yàn)所需，在保證量的前提下，應(yīng)盡量減少采樣個(gè)體的數(shù)量。  

3、 植物樣品：  植物材料應(yīng)盡量選取植物組織幼嫩部位。  

 

Illumina HiSeq 2000測序通量可達(dá)600G，適合全基因組測序。80×以上的測序深度，可以保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確以及SNP的發(fā)現(xiàn)。Illumina MiSeq的速度更快，但相對(duì)來說成本會(huì)較高。

派森諾生物擁有多個(gè)高端測序平臺(tái)，根據(jù)合作伙伴的實(shí)際需求，提供高性價(jià)比的動(dòng)植物基因組重測序。