微生物基因組從頭測序

推薦平臺：Roche 454 FLX+ 數(shù)據(jù)為主導(dǎo)，結(jié)合Illumina MiSeq和ABI 3730XL數(shù)據(jù)。

1、 細(xì)菌：濃度≥200 ng/μl，總量≥50 μg；OD260/280值介于1.8-2.0之間的細(xì)菌基因組DNA，并確保電泳檢測無明顯RNA條帶，基因組條帶清晰、完整，主帶應(yīng)在100 kb以上，DNA無降解，無污染。 
  

2、 真菌：樣品濃度≥200 ng/μl，總量≥50 μg，OD值介于1.8-2.0之間的DNA，樣品濃度越高越好。真菌的De novo 測序獲得精細(xì)圖，若基因組大小介于10~45Mb之間，需提供至少100μg的DNA，若基因組大小大于45Mb，則需200 μg的DNA。
  

3、 樣品保存期間切忌反復(fù)凍融。

4、 送樣管務(wù)必標(biāo)清樣品編號，管口使用Parafilm 膜密封。

5、 提供DNA電泳檢測照片，用自封袋密封后隨樣品一起送樣。

Roche 454 FLX+ System作為二代測序系統(tǒng)中讀長最長的測序系統(tǒng)（最長可達(dá)1000 bp），是進(jìn)行基因組de novo測序的最佳選擇。同時(shí)配合雙端測序試劑盒，進(jìn)行3 kb、8 kb和20 kb三種不同插入長度的雙端測序，使得在拼接中能夠跳過大范圍的重復(fù)區(qū)，極大地優(yōu)化了全基因組de novo拼接的結(jié)果。再結(jié)合Illumina和ABI 3730測序平臺，將為您提供高質(zhì)量的微生物基因組de novo測序服務(wù)。

派森諾生物擁有多個(gè)先進(jìn)的測序平臺，經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員及成熟的數(shù)據(jù)處理和信息分析系統(tǒng)，能夠根據(jù)合作伙伴的具體需求，設(shè)計(jì)最佳實(shí)驗(yàn)方案，第一時(shí)間提供專業(yè)、高效的全基因組de novo測序服務(wù)。

案例 

項(xiàng)目背景：基因組較大，GC含量高

研究目的：進(jìn)行全基因組測序，了解基因組的全貌