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擴(kuò)增子測序
原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估,序列比對與分析,根據(jù)客戶需求進(jìn)行個(gè)性化分析
服務(wù)類別:測序/合成總訪問:2703
最后更新:2013-9-3半年訪問:28
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  • 服務(wù)介紹
  • 公司簡介
簡介:擴(kuò)增子測序是對特定長度的PCR產(chǎn)物或者捕獲的片段進(jìn)行測序,分析序列中的變異。擴(kuò)增子測序能夠根據(jù)不同需求,對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行高覆蓋度的測序,還可以檢測到低頻突變。

二、信息分析
1. 原始數(shù)據(jù)整理、過濾及質(zhì)量評估
2. 序列比對與分析
與參考序列比對
SNPs和InDel的檢測
3.根據(jù)客戶需求進(jìn)行個(gè)性化分析

三、送樣要求
1. 樣品純度要求: OD值應(yīng)在1.82.0之間;電泳檢測無明顯非特異性雜帶,PCR產(chǎn)物條帶清晰、完整,混合PCR產(chǎn)物之間的長度差別不多于100bp。
2. 樣品濃度:純化后PCR產(chǎn)物濃度不低于10ng/ul。
3. 樣品總量:樣品總量不低于500ng。
4. 送樣管務(wù)必標(biāo)清樣品編號,管口使用Parafilm膜密封。仔細(xì)填寫DNA樣品信息表,提供DNA樣品具體濃度、體積、制備時(shí)間、溶劑名稱及物種來源。同時(shí)附上QC數(shù)據(jù),包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測數(shù)據(jù)。如需進(jìn)行多次樣品制備,需要提供多次樣品制備所需樣品。
5. 寄送樣品需要保持低溫環(huán)境,最好的方法是凍干郵寄,其次是溶于TE,當(dāng)然也可以溶于雙蒸水。

四、派森諾優(yōu)勢
派森諾生物擁有多個(gè)高端測序平臺(tái),其中Illumina Miseq平臺(tái)讀長長,速度快,靈活性強(qiáng),尤其適合于擴(kuò)增子測序,可以保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性以及變異位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)。
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