宏基因組測序是對環(huán)境樣品中的微生物群落的基因組進行高通量測序,主要研究微生物種群結構、基因功能活性、微生物之間的相互協(xié)作關系以及微生物與環(huán)境之間的關系。
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宏基因組研究策略的出現(xiàn),使得我們無需分離培養(yǎng)單個微生物,利用高通量測序技術即可對來自特定環(huán)境或人體部位的微生物群落展開全局研究。16S rDNA因其序列在物種間的高度多樣性,成為細菌分類學研究的“分子鐘”,其序列包含可變區(qū)和保守區(qū),可變區(qū)因細菌而異,且變異程度與細菌的系統(tǒng)發(fā)育密切相關。16S rDNA測序是通過提取微生物菌群的DNA,選擇可變區(qū)的特定區(qū)段進行PCR擴增,再結合高通量測序分析,幫助研究人員大規(guī)模鑒定細菌群落組成,表達豐度,以及開展系統(tǒng)進化分析,促進了我們對微生物群落與環(huán)境互作,以及與人類互作的理解。
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