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lncRNA測序

lncRNA測序


long non-code RNA sequencing
使用高通量測序技術(shù)結(jié)合最新的生物信息學(xué)分析平臺，助您全面深入地開啟lncRNA研究。
服務(wù)類別：測序/合成總訪問：836
最后更新：2014-1-15半年訪問：21
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        在最近十余年的生命科學(xué)研究中，對具有重要調(diào)控功能的非編碼RNA的研究可謂是其中最引人關(guān)注的領(lǐng)域之一，而長鏈非編碼RNA（long non-coding RNAs，lncRNAs）一經(jīng)登場，便迅速成為非編碼RNA界又一個耀眼的明星。lncRNAs是一類長度大于200 nt的非編碼RNA，廣泛存在于各種生物體內(nèi)，在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多種水平上對生命活動進行關(guān)鍵性的調(diào)控，與動植物的生長發(fā)育，人類的疾病發(fā)生有著密切關(guān)系，也可作為疾病診斷的標(biāo)志物或是重要靶點。聯(lián)川生物推出的lncRNA測序服務(wù)，使用高通量測序技術(shù)結(jié)合最新的生物信息學(xué)分析平臺，助您全面深入地開啟lncRNA研究。 
 
 
采用核糖體去除技術(shù)和鏈特異性文庫構(gòu)建方案，保留了完整的lncRNA和mRNA序列，以及序列方向性。
對包括人和動植物在內(nèi)的許多物種的lncRNA展開分析。
對樣本中幾乎全部的lncRNA和mRNA序列進行鑒定和分析。
系統(tǒng)收集lncRNA數(shù)據(jù)庫用于鑒定已知lncRNA，并設(shè)置嚴(yán)格的篩選條件用于發(fā)現(xiàn)新lncRNA。
展開lncRNA與mRNA的關(guān)聯(lián)分析，深入分析lncRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
 
 
 
 
Gut ：利用測序技術(shù)研究 lncRNA 對食管癌增殖與轉(zhuǎn)移的調(diào)控作用 

本研究采用RNA-Seq技術(shù)，對食管腺癌組織和配對的正常組織中的lncRNA進行鑒定和差異表達分析。共發(fā)現(xiàn)6216個lncRNAs在食管腺癌組織中表達，其中l(wèi)ncRNA HNF1A-AS1顯著過表達。敲除HNF1A-AS1能抑制食管腺癌細胞的增殖與轉(zhuǎn)移，并抑制癌癥相關(guān)lncRNA H19的表達。研究表明，HNF1A-AS1的失調(diào)參與了食管癌的發(fā)生，而該參與過程有可能部分受到染色質(zhì)與核小體組裝的改變及H19誘導(dǎo)的調(diào)節(jié)。 

Yang X. et al.（2013）Long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and migration in oesophageal adenocarcinoma cells. Gut. doi: 10.1136/gutjnl-2013-305266.
 
New Phytol ：利用測序技術(shù)研究擬南芥 lncRNA 應(yīng)答尖孢鐮刀菌侵染的分子機制 

      尖孢鐮刀菌（F. oxysporum）是一種世界性分布的土傳病原真菌，寄主范圍廣泛，可引起包括擬南芥和重要經(jīng)濟作物如棉花和番茄等100多種植物發(fā)生枯萎病，造成嚴(yán)重?fù)p失。
本研究采用鏈特異性RNA-Seq技術(shù)，對擬南芥中應(yīng)答F. oxysporum侵染的lncRNA展開分析。實驗發(fā)現(xiàn)許多與F. oxysporum侵染應(yīng)答相關(guān)的lncRNA，包括15個長鏈非編碼天然反義轉(zhuǎn)錄本（lncNATs）和20個lincRNAs。實驗證實上述部分的lncNATs和lincRNAs與擬南芥的F. oxysporum抗性密切相關(guān)。研究表明，鏈特異性RNA-Seq是發(fā)現(xiàn)隱藏著的轉(zhuǎn)錄組的有力工具，并證實lncRNAs是擬南芥抗真菌網(wǎng)絡(luò)中重要的節(jié)點。 

Zhou QK.（2013）Long noncoding RNAs responsive to Fusarium oxysporum infection inArabidopsis thaliana. New Phytology. DOI: 10.1111/nph.12537
 

 

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