ChIP-seq

ChIP-seq；免疫共沉淀測(cè)序

服務(wù)類(lèi)別：	測(cè)序/合成	總訪問(wèn)：	1378
最后更新：	2018-6-22	半年訪問(wèn)：	30
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服務(wù)商：北京閱微基因技術(shù)有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡(jiǎn)介

技術(shù)簡(jiǎn)介
染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱(chēng)結(jié)合位點(diǎn)分析法，是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具，通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)或組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的研究。將ChIP與第二代高通量測(cè)序技術(shù)相結(jié)合的ChIP-seq技術(shù)，能夠高效的在全基因組范圍內(nèi)檢測(cè)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA區(qū)段。ChIP-seq具有精確、靈敏、大量且成本低廉的優(yōu)點(diǎn)，實(shí)現(xiàn)了目標(biāo)蛋白在全基因組范圍內(nèi)的全部結(jié)合位點(diǎn)的定位。

技術(shù)路線圖

技術(shù)路線圖-28

生物信息學(xué)分析

技術(shù)路線圖-29

常規(guī)分析：
1. 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控分析
2. ChIP-seq序列與參考序列比對(duì)
3. 統(tǒng)計(jì)樣品中比對(duì)位置唯一的序列在基因上、基因間區(qū)的分布情況及覆蓋深度
4. 統(tǒng)計(jì)樣品Peak信息（峰檢測(cè)及計(jì)數(shù)、平均峰長(zhǎng)度、峰長(zhǎng)中位數(shù)）
5. Peak區(qū)域的基因組定位
6. 與Peak區(qū)域相關(guān)的DNA結(jié)合因子分析

高級(jí)分析：
7.Peak區(qū)域相關(guān)靶基因功能注釋及GO分析
8.Peak區(qū)域相關(guān)靶基因的代謝通路（pathway）分析
9.不同樣品Peak區(qū)域的差異分析

個(gè)性化分析：
10.根據(jù)客戶(hù)需求進(jìn)行個(gè)性化定制分析

案例解析

（Goren A, Ozsolak F, Shoresh N, et al., 2010）

Illumina和Helicos測(cè)序平臺(tái)產(chǎn)生的ChIP-seq數(shù)據(jù)比較分析，展示了使用CTCF, H3K4me3, H3K27me3 和H3K36me3四種特異性抗原富集小鼠胚胎干細(xì)胞19號(hào)染色體300Kb 區(qū)域DNA的結(jié)果。

測(cè)序策略及數(shù)據(jù)量
測(cè)序策略：SE50
建議數(shù)據(jù)量：10M、15M或20M clean reads

售后服務(wù)

閱微基因擁有一支專(zhuān)業(yè)的技術(shù)服務(wù)團(tuán)隊(duì)，具有高超的技術(shù)水平和豐富的管理經(jīng)驗(yàn)，隨時(shí)隨地為您提供幫助：
· 分布全國(guó)的運(yùn)營(yíng)中心、辦事處，輕松實(shí)現(xiàn)人員的迅速調(diào)配；
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· 每次技術(shù)服務(wù)后皆有電話回訪，確保服務(wù)的質(zhì)量。
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