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相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，RNA測序無需預先針對已知序列設計探針，即可在轉錄本水平和基因水平對整體轉錄活動進行檢測。
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RNA測序技術服務
相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，RNA測序無需預先針對已知序列設計探針，即可在轉錄本水平和基因水平對整體轉錄活動進行檢測。并且具有定量更準確，檢測通量更高，檢測范圍更廣等優(yōu)點。此外，在分析轉錄本的結構和表達水平的同時，還能發(fā)現(xiàn)未知轉錄本和稀有轉錄本，精確地識別可變剪切位點以及可能的點突變，提供最全面的轉錄組信息。
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康成生物基于Illumina高通量測序平臺，為您提供一站式RNA測序技術服務，您只需要提供保存完好的組織或細胞標本，康成的技術服務人員就可為您完成全部實驗操作，包括RNA抽提、rRNA去除、文庫構建、高通量測序和數(shù)據(jù)分析、并提供完整的實驗報告。 |
RNA-seq技術優(yōu)勢
- 數(shù)字化信號：直接測定每個轉錄本片段序列，單核苷酸分辨率的精確度，同時不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題。
- 高靈敏度：能夠檢測到細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本。
- 任意物種的全基因組表達分析：無需預先設計特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析。同時能夠檢測未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉錄本，并精確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區(qū)域。
- 更廣的檢測范圍：高于6個數(shù)量級的動態(tài)檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。
康成生物RNA-seq技術服務特色
1. 采用rRNA去除方法富集，檢測更為全面
采用去rRNA的方法進行RNA富集，同時保留帶PolyA尾和不帶PolyA尾的RNA，為您的研究提供全面可靠的數(shù)據(jù)。
*圖釋：康成生物的RNA富集方案能夠有效的保留帶PolyA尾巴和不帶PolyA尾巴的轉錄本，從而為客戶提供更加全面可靠的數(shù)據(jù)。
2. 可采用降解的RNA進行實驗，特別適用于臨床樣品（如FFPE樣品）的檢測
康成生物采用的去rRNA試劑盒能夠有效的去除降解的rRNA，對功能性的RNA分子進行有效的富集， 特別適用于臨床樣品的檢測。
*圖釋：康成生物的RNA富集方案適用于降解的RNA樣品。
3. 鏈特異性文庫構建
采用的鏈特異性文庫構建方法，可以有效區(qū)分正義鏈和反義鏈，幫助您同時獲得準確的正義鏈和反義鏈RNA的表達信息。
*圖釋：康成生物采用鏈特異性的建庫方法，可以有效區(qū)分正義轉錄本和反義轉錄本。
4.均勻覆蓋轉錄本，5’和3’端偏好性低
采用基于dUTP的建庫方案，Reads均勻覆蓋轉錄本，測序結果更可靠。
*圖釋：康成生物采用基于dUTP的建庫方法，測序結果無5’和3’偏好性。
康成生物RNA-seq數(shù)據(jù)結果展示
1. 基因集富集分析 (GSEA)：利用一列（排序的）基因進行基因集富集分析，能夠揭示這些基因在不同基因集間的富集情況。
*圖釋：基因集富集分析顯示在Cell Cycle Pathway基因集中富集
2. 網絡分析：通過GO富集分析挑選感興趣的GO term，對其中的基因構建基因網絡圖。
*圖釋：GO term-基因網絡圖，綠色和藍色：特異基因；紅色：共有基因
3. RNA-Seq和ChIP-Seq整合分析：通過整合RNA-Seq結果和ChIP-Seq富集峰，能夠更直觀地了解基因啟動子區(qū)的特征。
*圖釋：啟動子區(qū)的RNA-Seq和ChIP-Seq可視化信號
