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小RNA測序(miRNA + piRNA + siRNA)
云序生物Small RNA組測序服務可以在一次實驗中同時檢測所有small RNA,為研究small RNA的功能和調控機制,或者篩選新的small RNA提供了強有力的工具。
服務類別:測序/合成總訪問:6798
最后更新:2021-8-19半年訪問:81
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服務商: 上海云序生物科技有限公司 查看該公司所有服務 >>
  • 服務介紹
  • 公司簡介

     Small RNA是一類長度為18-30 nt,具有調控功能的非編碼小RNA的總稱。常見的small RNA主要包括:microRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA廣泛參與包括細胞生長、分化、凋亡在內的幾乎所有生理過程,并與包括癌癥在內的各種人類疾病相關。

    云序生物Small RNA組測序服務可以在一次實驗中同時檢測所有small RNA,為研究small RNA的功能和調控機制,或者篩選新的small RNA提供了強有力的工具。此外,云序生物還提供僅針對miRNA的測序服務,有效富集miRNA,在相同成本下提高了miRNA有效數(shù)據(jù)量和測序深度。

詳見:云序生物 小RNA測序服務

 

技術優(yōu)勢

  • 全物種覆蓋:無需預知序列信息,可對任意物種的small RNA組進行檢測
  • 同時檢測miRNA、piRNA和siRNA在一次實驗中同時檢測miRNA、piRNA、siRNA和其它small RNA
  • 實時更新的small RNA數(shù)據(jù)庫信息:可隨時利用最新的small RNA數(shù)據(jù)庫對數(shù)據(jù)進行再分析,數(shù)據(jù)永久有效
  • 靈敏度高:可檢測在單個細胞中僅一個拷貝的低豐度small RNA
  • 精確度高:可準確區(qū)分單堿基差異的small RNA

 

數(shù)據(jù)分析

基本分析

高級分析

1.  數(shù)據(jù)過濾和接頭序列去除

CS-MIR-001.  miRNA靶基因預測

2.  序列匹配與數(shù)據(jù)統(tǒng)計

CS-MIR-002.  miRNA靶基因的GO與信號通路分析

3.  已知小RNA(miRNA/siRNA/piRNA)識別,注釋和統(tǒng)計

CS-MIR-003.  miRNA-靶基因GO網(wǎng)絡分析

4.  小RNA表達量計算

CS-MIR-004.  miRNA-靶基因信號通路網(wǎng)絡分析

5.  差異小RNA篩選

CS-MIR-005.  miRNA上游轉錄因子分析

6.  小RNA表達聚類分析

CS-MIR-006.  新miRNA預測

 

CS-MIR-007.  miRNA分子標志物篩選

 

數(shù)據(jù)展示

 

云序服務內容

1. 測序服務

轉錄組

表觀遺傳組

基因組

真核生物

原核生物

miRNA測序

細菌sRNA測序

MeDIP測序

目標序列靶向測序

小RNA測序(miRNA, piRNA,siRNA)

原核生物mRNA測序

RRBS測序

外顯子組測序

lncRNA測序

宏轉錄組測序

全基因組甲基化測序

人類基因組重測序

環(huán)狀RNA測序

原核生物轉錄組測序

ChIP測序

16S rDNA測序

mRNA測序

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