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全基因組甲基化測(cè)序
利用亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化將DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶,再結(jié)合illumina高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)全基因組進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)比對(duì)參考基因組序列可在全基因組進(jìn)行單堿基分辨率的DNA甲基化圖譜分析。
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       全基因組甲基化測(cè)序首先利用亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化將DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶(甲基化的胞嘧啶保持不變),再結(jié)合illumina高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)全基因組進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)比對(duì)參考基因組序列可在全基因組進(jìn)行單堿基分辨率的DNA甲基化圖譜分析。


實(shí)驗(yàn)流程




技術(shù)參數(shù)


推薦測(cè)序方式:illumina 測(cè)序平臺(tái), PE150 ,建議至少30 X基因組大小
樣本要求:DNA≥2 μg ,濃度≥50ng/μl
建議對(duì)有參考基因組(注釋較完整)的物種進(jìn)行全基因組甲基化測(cè)序

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