全基因組甲基化測(cè)序首先利用亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化將DNA中未發(fā)生甲基化的胞嘧啶脫氨基轉(zhuǎn)變成尿嘧啶(甲基化的胞嘧啶保持不變),再結(jié)合illumina高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)全基因組進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)比對(duì)參考基因組序列可在全基因組進(jìn)行單堿基分辨率的DNA甲基化圖譜分析。
實(shí)驗(yàn)流程
技術(shù)參數(shù)
推薦測(cè)序方式:illumina 測(cè)序平臺(tái), PE150 ,建議至少30 X基因組大小
樣本要求:DNA≥2 μg ,濃度≥50ng/μl
建議對(duì)有參考基因組(注釋較完整)的物種進(jìn)行全基因組甲基化測(cè)序
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上海生物芯片有限公司成立于2001年8月,公司由上?萍紕(chuàng)業(yè)投資(集團(tuán))有限公司、上海張江(集團(tuán))有限公司、中科院上海有關(guān)院所、上海交通大學(xué)等在上海的國(guó)內(nèi)知名大學(xué)、研究所、醫(yī)院和企業(yè)共同組建而成,經(jīng)國(guó)家發(fā)展與改革委員會(huì)批準(zhǔn)公司建設(shè)和運(yùn)行“生物芯片上海國(guó)家工程研究中心”,是我國(guó)生物醫(yī)藥領(lǐng)域規(guī)模最大的生物技術(shù)國(guó)家工程研究中心之一,是全國(guó)生物樣本標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)(TC559)、中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會(huì)組織生物樣本庫(kù)分會(huì)(BBCMBA)與中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)腫瘤樣本整合研究分會(huì)的秘書(shū)處與主任委員單位。
通過(guò)二十余年的建設(shè)和發(fā)展,公司(中心)確立了以生物樣本庫(kù)、基因芯片、高通量測(cè)序、蛋白芯片、組織芯片、數(shù)字化病理、分子病理與生物信息學(xué)為核心平臺(tái)的技術(shù)創(chuàng)新服務(wù)體系,以分子醫(yī)學(xué)檢測(cè)技術(shù)和分子診斷產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)為核心競(jìng)爭(zhēng)力的產(chǎn)業(yè)化體系,形成科研和藥物研發(fā)技術(shù)服務(wù)、分子診斷產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)銷售和分子醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)三大主營(yíng)業(yè)務(wù),公司(中心)具備科研及公共技術(shù)平臺(tái)服務(wù)優(yōu)勢(shì)、成熟的科技成果轉(zhuǎn)化服務(wù)能力、國(guó)家工程研究中心品牌影響力等強(qiáng)大的自身資源及優(yōu)勢(shì)。