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通過染色質免疫沉淀（ChIP）檢測和測序技術相結合，ChIP測序（ChIP-Seq）成為鑒定轉錄因子及其他蛋白因子在全基因組范圍內的DNA結合位點的強有力方法。
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ChIP-SEQ
通過染色質免疫沉淀（ChIP）檢測和測序技術相結合，ChIP測序（ChIP-Seq）成為鑒定轉錄因子及其他蛋白因子在全基因組范圍內的DNA結合位點的強有力方法。在ChIP操作之后，通過特異抗體將DNA結合蛋白免疫沉淀。結合的DNA被同時沉淀、純化并測序。新一代測序（NGS）在ChIP上的應用已經揭示了一些在各種疾病和生物學通路（如發(fā)育和癌癥發(fā)展）中發(fā)揮作用的基因調控事件的線索。ChIP-Seq能夠在全基因組規(guī)模上實現(xiàn)對蛋白與核酸相互作用的全面檢測。
通過染色質免疫沉淀（ChIP）檢測和測序技術相結合，ChIP測序（ChIP-Seq）成為鑒定轉錄因子及其他蛋白因子在全基因組范圍內的DNA結合位點的強有力方法。在ChIP操作之后，通過特異抗體將DNA結合蛋白免疫沉淀。結合的DNA被同時沉淀、純化并測序。新一代測序（NGS）在ChIP上的應用已經揭示了一些在各種疾病和生物學通路（如發(fā)育和癌癥發(fā)展）中發(fā)揮作用的基因調控事件的線索。ChIP-Seq能夠在全基因組規(guī)模上實現(xiàn)對蛋白與核酸相互作用的全面檢測。
- ChIP-Seq的優(yōu)點
- 可在任何生物體的整個基因組中捕獲轉錄因子或組蛋白修飾的DNA靶點
- 確定轉錄因子的結合位點
- 結合RNA測序和甲基化分析，揭示基因調控網絡
- 可兼容不同起始量的DNA樣品
無偏向性地研究表觀遺傳模式
ChIP-Seq可鑒定DNA結合蛋白的結合位點，可用于定位一個給定蛋白的整體結合位點。芯片及其他研究表觀基因組的方法往往有著內在的偏向性，因為它們需要來自已知序列的探針，ChIP-Seq則不同，不需要任何先驗知識。ChIP-Seq通過大規(guī)模并行測序提供全基因組的圖譜，產生覆蓋多個樣品的數百萬次計數分析，實現(xiàn)經濟且精確的分析
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