采用Illumina測(cè)序平臺(tái),對(duì)真核生物特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有mRNA進(jìn)行測(cè)序,與參考基因組比對(duì)
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真核有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序采用Illumina測(cè)序平臺(tái),對(duì)真核生物特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有mRNA進(jìn)行測(cè)序,與參考基因組比對(duì),既可全面快速分析mRNA序列和豐度信息、又可對(duì)基因結(jié)構(gòu)和產(chǎn)生的新轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分析。
基于優(yōu)質(zhì)的測(cè)序平臺(tái),通過(guò)reads與參考基因組比對(duì),系統(tǒng)全面的對(duì)基因表達(dá)定量和結(jié)構(gòu)分析,獲得某個(gè)物種在特定條件下的轉(zhuǎn)錄信息。
從材料選取,建庫(kù)測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì),以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序項(xiàng)目信息分析,經(jīng)過(guò)嚴(yán)格數(shù)據(jù)質(zhì)控保證數(shù)據(jù)分析可靠性,信息分析分為表達(dá)水平分析和結(jié)構(gòu)水平分析。
基因結(jié)構(gòu)水平分析 | 基因表達(dá)水平分析 |
與參考基因組比對(duì) | 基因表達(dá)水平分析 |
新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè) | 差異基因分析 |
可變剪切分析 | GO/KEGG富集分析 |
SNP分析 | 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
InDel分析 | 轉(zhuǎn)錄因子注釋 |
真核有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序采用先進(jìn)的Illumina測(cè)序平臺(tái),快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。
至2015年12月,諾禾致源已經(jīng)成功對(duì)水稻、擬南芥、番茄、花生、棉花、黃瓜、人、大鼠、等150多個(gè)有參考基因組的物種進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,并助力研究者在Cell Stem Cell、Genome Research、Nature Communications 等權(quán)威期刊發(fā)表高水平文章多篇。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì),嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”,
確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。