采用Illumina測序平臺,對真核生物特定組織或細胞在某個特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有RNA進行測序,拼接出最長的轉(zhuǎn)錄本為unigene,以unigene為參考序列進行后續(xù)分析
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真核無參轉(zhuǎn)錄組測序采用Illumina測序平臺,對真核生物特定組織或細胞在某個特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有RNA進行測序,拼接出最長的轉(zhuǎn)錄本為unigene,以unigene為參考序列進行后續(xù)分析,
為研究無參考基因組物種的轉(zhuǎn)錄水平變化提供有力的技術手段。
基于優(yōu)質(zhì)的測序平臺,利用國際認可的拼接軟件進行轉(zhuǎn)錄本拼接、注釋后,全方位分析基因表達水平和結(jié)構(gòu)信息,實現(xiàn)無參物種研究內(nèi)容最大化。
從材料選取,建庫測序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源無參轉(zhuǎn)錄組測序項目信息分析,經(jīng)過嚴格數(shù)據(jù)質(zhì)控保證數(shù)據(jù)分析可靠性,信息分析分為表達水平分析和結(jié)構(gòu)水平分析。
了解更多>>轉(zhuǎn)錄本拼接組裝 | 基因表達水平定量 |
基因功能注釋(7大數(shù)據(jù)庫) | 樣品間相關性分析 |
CDS預測 | 基因差異表達分析 |
SNP分析 | 差異表達基因功能富集分析 |
SSR分析 | 差異表達基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡分析 |
轉(zhuǎn)錄因子注釋 | 分析結(jié)果可視化 |
真核無參轉(zhuǎn)錄組采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節(jié)點和Isilon存儲的高效組合,實現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務的發(fā)展,高性能計算平臺將會持續(xù)更新并擴容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。
至2015年12月,諾禾致源已經(jīng)成功對櫻桃、蚊子、草莓、牡蠣、鯽魚、夜蛾等300多個無參考基因組物種進行了轉(zhuǎn)錄組測序分析,助力研究者在Plant biotechnology journal、Scientific Reports 、BMC Genomics等著名期刊發(fā)表高水平文章。
“科學的方案設計,嚴格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團隊,豐富的項目經(jīng)驗,優(yōu)質(zhì)的項目服務”,
確保每一個環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學研究。