 |
基于Illumina測序平臺，構建鏈特異性文庫，研究原核生物在某個時期或者在某種環(huán)境條件下轉錄出來的所有mRNA
|
|||||||||||||||||
| [發(fā)表評論] [本類其他服務] [本類其他服務商] | ||||||||||||||||||
| 服務商： 北京諾禾致源科技股份有限公司 | 查看該公司所有服務 >> |
原核轉錄組測序是基于Illumina測序平臺，構建鏈特異性文庫，研究原核生物在某個時期或者在某種環(huán)境條件下轉錄出來的所有mRNA。由于原核生物mRNA沒有polyA尾結構，需要采用去除rRNA的方法構建文庫，諾禾致源針對不同的研究物種采取有效的方法去除rRNA，保證數(shù)據(jù)質量。
基于高通量測序，分析物種在特定條件下轉錄所得所有mRNA信息，系統(tǒng)全面的分析mRNA在結構和表達水平的變化，為原核生物的深入研究奠定基礎。
從材料選取，建庫測序，到數(shù)據(jù)分析，每一步都需要科學、縝密的設計，以保障高質量研究成果。
諾禾致源原核轉錄組測序項目，除了基因表達以及差異基因之外，還包括多項基因結構水平的分析。此外，諾禾致源提供個性化分析的服務，可以根據(jù)客戶需求定制分析內容。
| 基因結構水平分析 | 基因表達水平分析 |
| 參考基因組比對 | 參考基因組比對 |
| 新轉錄本預測 | 測序質量評估 |
| UTR分析 | 基因表達水平分析 |
| 反義轉錄本預測 | 差異基因表達水平分析 |
| sRNA分析 | 差異基因GO/KEGG富集分析 |
| SNP和InDel分析 | 差異基因蛋白互作網(wǎng)絡分析 |
| 可視化結果展示 |
原核轉錄組采用先進的Illumina測序平臺，快速、高效地讀取高質量的測序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計算平臺（High Performance Computing，HPC）采用DELL計算節(jié)點和Isilon存儲的高效組合，實現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務的發(fā)展，高性能計算平臺將會持續(xù)更新并擴容，以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。
至2015年12月，諾禾致源已經(jīng)成功對大腸桿菌、鮑曼不動桿菌、副溶血弧菌、熒光假單胞菌、牙齦卟啉單胞菌、水稻黃單胞桿菌、水稻條斑病菌、乳酸菌、鏈霉菌、發(fā)狀念珠藻、小球藻、擬柱胞藻、嗜鹽古菌等100多個物種進行原核轉錄組測序分析，并在該領域研究的權威期刊發(fā)表針對嗜鹽古菌、產甲烷古菌等物種的mRNA研究成果。
“科學的方案設計，嚴格的質控管理，專業(yè)的分析團隊，豐富的項目經(jīng)驗，優(yōu)質的項目服務”，
確保每一個環(huán)節(jié)都能出色完成，助力科學研究。
