從整體水平上研究某一特定環(huán)境,特定時期群體生命全部基因組轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的研究手段,它以生態(tài)環(huán)境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養(yǎng)困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間
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宏轉(zhuǎn)錄組(Metatranscriptome)測序是指從整體水平上研究某一特定環(huán)境,特定時期群體生命全部基因組轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的研究手段,它以生態(tài)環(huán)境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養(yǎng)困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間。相較于宏基因組,宏轉(zhuǎn)錄組能從轉(zhuǎn)錄水平研究復(fù)雜微生物群落變化,能更好的挖掘潛在的新基因。
諾禾致源宏轉(zhuǎn)錄組研究采用先進的測序平臺,高通量覆蓋可全面檢測生態(tài)環(huán)境中的微生物信息,
充分挖掘樣品中存在的微生物多樣性及動態(tài)變化情況。具有“短周期、高通量、全分析”的優(yōu)勢,已廣泛應(yīng)用于腸道內(nèi)容物、土壤、水體等研究中。
從材料選取,建庫測序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計,以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源宏轉(zhuǎn)錄組測序項目,不僅進行基因表達情況以及差異基因表達分析,還進行物種注釋及分類分析,多樣品間的比較分析等。此外,諾禾致源提供個性化分析的服務(wù),可以根據(jù)客戶需求定制分析內(nèi)容。
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物種注釋及分類 |
功能注釋(KEGG,eggNOG,CAZy) |
Nr數(shù)據(jù)庫比對 |
GO富集 |
KEGG富集 |
多樣品比較分析 |
宏轉(zhuǎn)錄組采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節(jié)點和Isilon存儲的高效組合,實現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計算平臺將會持續(xù)更新并擴容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。
至2016年5月,諾禾致源已經(jīng)成功對土壤、污水、淤泥、昆蟲腸道、口腔、糞便等多種生態(tài)環(huán)境中的微生物進行了宏轉(zhuǎn)錄組測序。
“科學(xué)的方案設(shè)計,嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團隊,豐富的項目經(jīng)驗,優(yōu)質(zhì)的項目服務(wù)”,
確保每一個環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。