采用Illumina測序平臺,對腫瘤組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有mRNA進(jìn)行測序,與參考基因組比對
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醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)錄組測序采用Illumina測序平臺,對腫瘤組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有mRNA進(jìn)行測序,與參考基因組比對,既可全面快速地獲得mRNA序列和表達(dá)豐度信息,又可進(jìn)行融合基因、可變剪切等結(jié)構(gòu)分析。
基于優(yōu)質(zhì)的測序平臺,系統(tǒng)全面的分析組織或細(xì)胞在特定條件下轉(zhuǎn)錄所得所有mRNA信息,深度挖掘轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)信息,助力醫(yī)學(xué)研究。
從材料選取,建庫測序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì),以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)錄組測序項(xiàng)目信息分析,經(jīng)過嚴(yán)格數(shù)據(jù)質(zhì)控保證數(shù)據(jù)分析可靠性,信息分析分為表達(dá)水平分析和結(jié)構(gòu)水平分析。
基因結(jié)構(gòu)水平分析 | 基因表達(dá)水平分析 |
與參考基因組比對 | 基因表達(dá)水平分析 |
新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測 | RNA-seq整體質(zhì)量評估 |
可變剪切分析 | 差異基因分析 |
SNP/InDel注釋分析 | GO/KEGG富集分析 |
融合基因分析 | 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
癌基因注釋 | 轉(zhuǎn)錄因子注釋 |
醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)錄組測序采用先進(jìn)的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計(jì)算平臺將會持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。
至2015年12月,諾禾致源已與協(xié)和醫(yī)學(xué)院、安貞醫(yī)院、北京天壇醫(yī)院等遍布全國范圍的多家醫(yī)院建立了良好的合作關(guān)系,進(jìn)行了深入合作,已在Cell Stem Cell 、Nature Structural & Molecular Biology、Genome Research、Nature Communications等權(quán)威期刊發(fā)表多篇高水平文章。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì),嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”,確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。