在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù),針對(duì)單個(gè)細(xì)胞研究其整體水平的基因表達(dá)情況
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single cell RNA sequencing)是在單個(gè)細(xì)胞水平對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序的一項(xiàng)新技術(shù),針對(duì)單個(gè)細(xì)胞研究其整體水平的基因表達(dá)情況,成功解決細(xì)胞分子機(jī)制研究中常見的細(xì)胞異質(zhì)性、細(xì)胞量少而無(wú)法進(jìn)行常規(guī)高通量測(cè)序等難題。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)主要用于在全基因組范圍內(nèi)挖掘基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),尤其適用于存在高度異質(zhì)性的干細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞及胚胎發(fā)育早期的細(xì)胞群體。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析有助于深入理解細(xì)胞分化、細(xì)胞重編程及轉(zhuǎn)分化等過程及相關(guān)的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
從材料選取,建庫(kù)測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì),以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序項(xiàng)目,不僅包括基因的結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)水平的分析,還包括細(xì)胞亞型的分類,癌基因及轉(zhuǎn)錄因子的注釋。此外,諾禾致源提供個(gè)性化分析的服務(wù),可以根據(jù)客戶需求定制分析內(nèi)容。
了解更多>>基因結(jié)構(gòu)水平分析 | 基因表達(dá)水平分析 |
數(shù)據(jù)質(zhì)控 參考基因組比對(duì) 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè) 基因結(jié)構(gòu)優(yōu)化 可變剪切事件分類 可變剪切數(shù)量統(tǒng)計(jì) 變異檢測(cè)SNP/InDel分析 |
數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 基因表達(dá)水平分析 差異基因表達(dá)水平分析 差異基因GO/KEGG富集分析 差異基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析 RNA-seq整體質(zhì)量評(píng)估 可視化結(jié)果展示 |
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序采用先進(jìn)的Illumina測(cè)序平臺(tái),快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。
2015年11月,Clontech認(rèn)證諾禾致源為中國(guó)地區(qū)唯一單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序合作伙伴,已建立SMARTer ® v4 UltraTM Low Input RNA Kit for Sequencing方法的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序體系,對(duì)包括人、大鼠、小鼠、斑馬魚、豬、牛、羊、雞等十多個(gè)物種,生殖、胚胎、腫瘤、血液、淋巴、神經(jīng)、心血管等不同組織來(lái)源,經(jīng)多種單細(xì)胞分選方法得到的近千例樣本進(jìn)行了擴(kuò)增,經(jīng)測(cè)序及數(shù)據(jù)分析后,已在Nature Structural & Molecular Biology雜志上發(fā)表高水平項(xiàng)目文章。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì),嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”,
確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。