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借轉(zhuǎn)錄組研究之力解秘物種進化

比較轉(zhuǎn)錄組測序是基于Illumina測序平臺，通過RNA-seq技術(shù)手段研究物種進化，通過不同物種或亞種間mRNA序列差異進而分析近源物種間的親緣關(guān)系，挖掘明顯受到正向選擇或負向選擇的基因。泛轉(zhuǎn)錄組測序不僅能分析比較轉(zhuǎn)錄組的內(nèi)容，同時還可以構(gòu)建共表達網(wǎng)絡(luò)，挖掘關(guān)鍵基因模塊。

高效，精準，超值。

比較轉(zhuǎn)錄組與泛轉(zhuǎn)錄組測序是一種快速、全面解析不同品系、不同亞種進化關(guān)系及特定組織表達情況的生物學(xué)方法，以期從序列水平和基因表達水平發(fā)掘物種進化歷程。具有“高效、基因定位準、超值”的優(yōu)勢，已廣泛應(yīng)用于水稻、擬南芥、番茄等物種的進化研究。

科學(xué)方案設(shè)計

從材料選取，建庫測序，到數(shù)據(jù)分析，每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計，以保障高質(zhì)量研究成果。

信息分析

諾禾致源比較轉(zhuǎn)錄組與泛轉(zhuǎn)錄組測序，通過對樣本的轉(zhuǎn)錄本進行單獨拼接，篩選直系同源基因，研究進化關(guān)系，挖掘主效基因集。

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分析內(nèi)容

轉(zhuǎn)錄本拼接

直系同源基因查找

直系同源基因Ka／Ks分析

PCA分析

系統(tǒng)進化樹構(gòu)建

表達水平進化分析（泛轉(zhuǎn)錄組特有）

共表達網(wǎng)絡(luò)模塊構(gòu)建（泛轉(zhuǎn)錄組特有）

悅讀高質(zhì)量測序數(shù)據(jù)，盡享HPC澎湃動力

比較轉(zhuǎn)錄組與泛轉(zhuǎn)錄組采用先進的Illumina測序平臺，快速、高效地讀取高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。諾禾致源高性能計算平臺（High Performance Computing，HPC）采用DELL計算節(jié)點和Isilon存儲的高效組合，實現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展，高性能計算平臺將會持續(xù)更新并擴容，以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。

出色完成每一個項目環(huán)節(jié)

至2015年12月，諾禾致源已經(jīng)成功對番茄、苧麻、裂腹魚、蛙、沙拐棗、枸杞、核桃、黃岑等30多個物種進行比較轉(zhuǎn)錄組或泛轉(zhuǎn)錄組測序分析，已在Plant Molecular Biology等權(quán)威期刊發(fā)表多篇研究成果。
“科學(xué)的方案設(shè)計，嚴格的質(zhì)控管理，專業(yè)的分析團隊，豐富的項目經(jīng)驗，優(yōu)質(zhì)的項目服務(wù)”，
確保每一個環(huán)節(jié)都能出色完成，助力科學(xué)研究。

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