采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,針對(duì)有參考基因組樣本開(kāi)展準(zhǔn)確的lncRNA鑒定和lncRNA靶基因預(yù)測(cè)
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長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一類長(zhǎng)度超過(guò)200 nt的長(zhǎng)鏈非編碼RNA,通過(guò)與DNA、RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合,在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后等水平調(diào)控基因表達(dá)。
測(cè)序采用Illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,針對(duì)有參考基因組樣本開(kāi)展準(zhǔn)確的lncRNA鑒定和lncRNA靶基因預(yù)測(cè),同時(shí)提供針對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)中mRNA的分析,結(jié)果更全面,廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)、農(nóng)學(xué)研究領(lǐng)域。
LncRNA的研究作為RNA研究的新領(lǐng)域,在生產(chǎn)、生活、健康方面具有重要意義,可通過(guò)不同的分子生物學(xué)機(jī)制調(diào)控編碼基因的表達(dá),在生產(chǎn)上對(duì)物種的改良,在人類健康方面參與疾病相關(guān)的信號(hào)通路從而對(duì)疾病的發(fā)生發(fā)展及治療有重要作用。
從材料選取,建庫(kù)測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì),以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源lncRNA測(cè)序項(xiàng)目,利用六步法對(duì)lncRNA進(jìn)行準(zhǔn)確篩選,高效預(yù)測(cè)靶基因,并完成對(duì)轉(zhuǎn)錄本中mRNA的分析,以及l(fā)ncRNA和mRNA的比較分析、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建。
了解更多>>lncRNA分析 | mRNA分析 |
lncRNA拼接組裝 lncRNA位點(diǎn)篩選 lncRNA編碼潛能分析 lncRNA描述性統(tǒng)計(jì) lncRNA靶基因預(yù)測(cè) lncRNA保守性分析 ORF長(zhǎng)度分析及exon個(gè)數(shù)分析 表達(dá)水平分析及差異表達(dá)分析 |
反義轉(zhuǎn)錄本鑒定 可變剪切分析 差異基因富集分析 TSS和TTS位點(diǎn)統(tǒng)計(jì) SNP/InDel分析 mRNA保守性分析 ORF長(zhǎng)度分析及exon個(gè)數(shù)分析 表達(dá)水平分析及差異表達(dá)分析 |
差異表達(dá)lncRNA的靶基因與差異表達(dá)mRNA取交集 lncRNA-mRNA 共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 |
長(zhǎng)鏈非編碼RNA測(cè)序采用先進(jìn)的Illumina測(cè)序平臺(tái),快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。
至2015年12月,諾禾致源已經(jīng)成功對(duì)牛、鼠、兔、雞、蝴蝶、蜜蜂、線蟲(chóng)、沙棘、香蕉、棉花、小等近70多個(gè)物種進(jìn)行l(wèi)ncRNA測(cè)序分析,并在Nature Structural & Molecular Biology等期刊發(fā)表針對(duì)人、豬、羊等物種的lncRNA研究成果。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì),嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”,
確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。