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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究利器

近年來(lái)，已有多種單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)及平臺(tái)應(yīng)運(yùn)而生，10x Genomics基于DROPLET細(xì)胞均分原理，可在極短時(shí)間內(nèi)同時(shí)獲得數(shù)十萬(wàn)個(gè)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組信息，而且相較于其他平臺(tái)，成本大大降低。

新穎，精準(zhǔn)，卓越

廣泛應(yīng)用于血液病、腫瘤細(xì)胞異質(zhì)性、鑒定罕見(jiàn)細(xì)胞類(lèi)型、免疫細(xì)胞分型、疾病分型等領(lǐng)域；主要是針對(duì)大量細(xì)胞進(jìn)行亞型分類(lèi)，可結(jié)合傳統(tǒng)全長(zhǎng)序列的擴(kuò)增進(jìn)行精確定量，精準(zhǔn)揭秘疾病分子機(jī)制。

科學(xué)方案設(shè)計(jì)

從材料選取，建庫(kù)測(cè)序，到數(shù)據(jù)分析，每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì)，以保障高質(zhì)量研究成果。

信息分析

Cell Ranger™分析流程是針對(duì)10x Genomics® Chromium™ 3’單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序開(kāi)發(fā)的完整分析流程，包括數(shù)據(jù)拆分、對(duì)細(xì)胞數(shù)目進(jìn)行統(tǒng)計(jì)、基因表達(dá)定量、聚類(lèi)及差異分析等。

1. 基本數(shù)據(jù)分析，細(xì)胞數(shù)目統(tǒng)計(jì)，單個(gè)細(xì)胞 reads 數(shù)目統(tǒng)計(jì)等；

2. 質(zhì)控分析，通過(guò)對(duì) UMI 分析判定 PCR 擴(kuò)增效率；

3. 基因表達(dá)定量，獲得表達(dá)基因及其表達(dá)量數(shù)據(jù)；

4. 聚類(lèi)分析，選用 tSNE 進(jìn)行聚類(lèi)分析。

悅讀高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù)，盡享HPC澎湃動(dòng)力

10x Genomics采用先進(jìn)的Illumina測(cè)序平臺(tái)，快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)（High Performance Computing，HPC）采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合，實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展，高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容，以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。

出色完成每一個(gè)項(xiàng)目環(huán)節(jié)

至2015年12月，諾禾致源已經(jīng)成功對(duì)豬、牛、鼠、南極魚(yú)、鱘魚(yú)、紅旗東方魨、大鯢、
揚(yáng)子鱷、梭子蟹、對(duì)蝦、扇貝、海參、瘧原蟲(chóng)、蝗蟲(chóng)等300多個(gè)物種進(jìn)行small RNA測(cè)序分析，
并在Plant Cell、Scientific reports等權(quán)威期刊發(fā)表文章20多篇。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì)，嚴(yán)格的質(zhì)控管理，專(zhuān)業(yè)的分析團(tuán)隊(duì)，豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”，
確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成，助力科學(xué)研究。

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