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前沿技術(shù)帶你走進(jìn)DNA的三維空間

Hi-C技術(shù)是染色體構(gòu)象捕獲（Chromosome conformation capture，簡(jiǎn)稱(chēng)為3C）的一種衍生技術(shù)，是指基于高通量進(jìn)行染色體構(gòu)象的捕獲，它能夠在全基因組范圍內(nèi)捕捉不同基因座位之間的空間交互信息，研究三維空間中調(diào)控基因的DNA元件。

高通量染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)

Hi-C技術(shù)是高通量染色體構(gòu)象捕獲技術(shù)
（High-throughput chromosome conformation capture）。
利用高通量測(cè)序技術(shù)，結(jié)合生物信息學(xué)分析方法，研究全基因組范圍內(nèi)整個(gè)染色質(zhì)DNA在空間位置上的關(guān)系，構(gòu)建染色體跨度單體型，同時(shí)捕獲不同基因座位上之間的空間交互信息，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息，并能開(kāi)發(fā)調(diào)控基因的DNA元件。

科學(xué)方案設(shè)計(jì)

從材料選取，建庫(kù)測(cè)序，到數(shù)據(jù)分析，每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì)，以保障高質(zhì)量研究成果。

信息分析

分析內(nèi)容=標(biāo)準(zhǔn)分析+高級(jí)分析。
構(gòu)建染色體跨度單體型，基于全基因組的互作信息，獲得高分辨率的染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)信息，并能開(kāi)發(fā)調(diào)控基因的DNA元件。此外，還可結(jié)合轉(zhuǎn)錄組，重測(cè)序和ChIP-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行聯(lián)合分析，從堿基變化、基因表達(dá)、蛋白修飾及染色體三維構(gòu)象分析等多方面深入探討生物學(xué)問(wèn)題。

構(gòu)建染色體跨度單體型	三維結(jié)構(gòu)重構(gòu)以及調(diào)控元件開(kāi)發(fā)
測(cè)序質(zhì)量評(píng)估
Hi-C數(shù)據(jù)質(zhì)控比對(duì)統(tǒng)計(jì)
插入片段統(tǒng)計(jì)
NT庫(kù)比對(duì)
比對(duì)參考基因組	比對(duì)及過(guò)濾
SNP檢測(cè)與注釋	互作圖譜構(gòu)建
InDel檢測(cè)與注釋	TAD分析
基因組雜合度統(tǒng)計(jì)	三維結(jié)構(gòu)重構(gòu)
染色體跨度單體型構(gòu)建	調(diào)控元件的開(kāi)發(fā)

悅讀高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù)，盡享HPC澎湃動(dòng)力

Hi-C技術(shù)采用先進(jìn)的HiSeq PE150平臺(tái)，快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)（High Performance Computing，HPC）采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合，實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展，高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容，以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。

出色完成每一個(gè)項(xiàng)目環(huán)節(jié)

至2017年12月，已經(jīng)成功實(shí)現(xiàn)人、小鼠、大鼠、禽類(lèi)、哺乳動(dòng)物、魚(yú)類(lèi)、貝類(lèi)、微生物類(lèi)（真菌和原核生物）、擬南芥、水稻、玉米、大豆、棉花、小麥、油菜、花生、果樹(shù)、林木、蔬菜等多種動(dòng)植物的Hi-C測(cè)序和分析。
多樣化的樣本類(lèi)型均可成功進(jìn)行Hi-C文庫(kù)構(gòu)建，同時(shí)先進(jìn)完善的實(shí)驗(yàn)流程和測(cè)序平臺(tái)，保證優(yōu)質(zhì)的有效數(shù)據(jù)。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì)，嚴(yán)格的質(zhì)控管理，專(zhuān)業(yè)的分析團(tuán)隊(duì)，豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)，優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”，
確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成，助力科學(xué)研究。

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Hi-C DNA三維空間捕獲技術(shù)