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DAP-seq效應(yīng)因子、轉(zhuǎn)錄因子、調(diào)控因子、未知蛋白結(jié)合位點(diǎn)

DAP-seq效應(yīng)因子、轉(zhuǎn)錄因子、調(diào)控因子、未知蛋白結(jié)合位點(diǎn)


DAP-seq---尋找效應(yīng)因子、轉(zhuǎn)錄因子、調(diào)控因子、未知蛋白與DNA結(jié)合位點(diǎn)--motif與基因list
一年時(shí)間已做200+DAP-seq實(shí)驗(yàn),具有豐富的實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)中用真核蛋白表達(dá)體系,實(shí)驗(yàn)流程不斷優(yōu)化,成功路不斷提高。
無(wú)需抗體、快速、高通量、價(jià)格低、時(shí)間短、不受物種限制。
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):691
最后更新:2024-8-6半年訪問(wèn):46
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在基因組水平上,鑒定轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)(transcription factor binding sites, TFBS)非常重要。ChIP-seq是進(jìn)行體內(nèi)檢測(cè)TFBS的主要方法。然而,ChIP-seq依賴于抗體質(zhì)量,這對(duì)低表達(dá)的蛋白質(zhì)具有很大的挑戰(zhàn)性。所以,ChIP-seq通常在規(guī)模上受到限制,難以進(jìn)行高通量擴(kuò)展。因此,只有少數(shù)轉(zhuǎn)錄因子可以獲得結(jié)合位點(diǎn)信息,大量TFBS的覆蓋范圍僅適用于人類和一些模式生物。
DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過(guò)體外蛋白表達(dá)技術(shù),表達(dá)出帶有標(biāo)簽的轉(zhuǎn)錄因子,和基因組DNA文庫(kù)在體外進(jìn)行結(jié)合,然后分離出所有與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的DNA,再使用高通量測(cè)序,找到轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。 
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DAP-seq的優(yōu)勢(shì)
與ChIP-seq相比,DAP-seq不需要針對(duì)每個(gè)轉(zhuǎn)錄因子制備特異性抗體。具有快速、高通量、節(jié)約時(shí)間成本的優(yōu)勢(shì),并且適用于所有的真核生物。
 
藍(lán)景科信提供DAP-seq全流程技術(shù)服務(wù)+個(gè)性化數(shù)據(jù)分析,具有豐富的技術(shù)服務(wù)經(jīng)驗(yàn)。
已經(jīng)做過(guò)的材料包括:擬南芥,水稻,小麥,玉米,大豆,苜蓿,百脈根,菜心,棗,荔枝,香蕉,毛果楊,胡楊,油松。
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