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染色質(zhì)免疫共沉淀與測(cè)序 (ChIP-seq)

染色質(zhì)免疫共沉淀與測(cè)序 (ChIP-seq)


Chromatin Immunoprecipitation sequenceing (ChIP-seq)
ChIP-seq技術(shù)通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)以及組蛋白特異性修飾位點(diǎn)的研究。其將染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP)與高通量測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的經(jīng)典實(shí)驗(yàn)方法。
服務(wù)類(lèi)別:測(cè)序/合成總訪(fǎng)問(wèn):511
最后更新:2021-8-4半年訪(fǎng)問(wèn):64
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ChIP-seq技術(shù)的應(yīng)用:
  • 應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的研究:ChIP-seq技術(shù)廣泛應(yīng)用于與轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的生物學(xué)作用與相關(guān)機(jī)制的研究。分析轉(zhuǎn)錄因子在不同細(xì)胞、不同狀態(tài)下所發(fā)揮的作用;
  • 應(yīng)用于組蛋白修飾的研究:ChIP-seq技術(shù)亦常應(yīng)用于研究組蛋白的修飾分布,通過(guò)觀察組蛋白修飾的分布情況,進(jìn)一步明確組蛋白修飾所發(fā)揮的生物學(xué)作用;
  • 應(yīng)用于核小體定位研究:運(yùn)用ChIP-seq技術(shù)研究核小體的分布規(guī)律,進(jìn)而分析得知核小體對(duì)基因表達(dá)所產(chǎn)生的影響。
ChIP-seq的技術(shù)優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:
  • 全基因組覆蓋:ChIP-seq相較于傳統(tǒng)的ChIP芯片,能夠?qū)崿F(xiàn)全基因組范圍的、單堿基水平的蛋白結(jié)合位點(diǎn)篩選與鑒定;
  • 高靈敏度:每個(gè)樣本可獲得數(shù)百萬(wàn)條的序列標(biāo)簽,可發(fā)現(xiàn)研究基因組上稀有的蛋白結(jié)合位點(diǎn);
  • 高精確率:可獲得高水平的信噪比數(shù)據(jù),準(zhǔn)確區(qū)分真實(shí)事件與噪音,精確定位蛋白結(jié)合位點(diǎn)。
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