真核無參轉(zhuǎn)錄組測序

對真核生物特定組織或細(xì)胞在某個特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有RNA進(jìn)行測序，拼接出最長的轉(zhuǎn)錄本為unigene，以unigene為參考序列進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本拼接、注釋，全面分析基因表達(dá)水平和結(jié)構(gòu)信息。

服務(wù)類別：	測序/合成	總訪問：	199
最后更新：	2023-4-23	半年訪問：	13
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服務(wù)商：上海中科新生命生物科技有限公司

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服務(wù)介紹
公司簡介

基于Illumina 測序平臺，真核無參轉(zhuǎn)錄組測序采用Illumina Hiseq平臺，對真核生物特定組織或細(xì)胞在某個特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有RNA進(jìn)行測序，拼接出最長的轉(zhuǎn)錄本為unigene，以unigene為參考序列進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本拼接、注釋，全面分析基因表達(dá)水平和結(jié)構(gòu)信息。

實(shí)驗(yàn)流程

應(yīng)用方向

生物領(lǐng)域各個研究方面，如：
▶ 農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機(jī)制，生長發(fā)育機(jī)制，育種保護(hù)研究等
▶ 微生物領(lǐng)域：致病機(jī)理，耐藥機(jī)制，病原體-宿主相互作用研究等
▶ 海洋水產(chǎn)：漁業(yè)資源，海水養(yǎng)殖，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
▶ 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機(jī)理機(jī)制，疾病分型，個性化治療等

數(shù)據(jù)分析

轉(zhuǎn)錄本拼接組裝	基因表達(dá)水平定量
基因功能注釋（7大數(shù)據(jù)庫）	樣品間相關(guān)性分析
CDS預(yù)測	基因差異表達(dá)分析
SNP分析、Indel分析	差異表達(dá)基因功能富集分析
SSR分析	差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析
轉(zhuǎn)錄因子注釋	個性化分析

技術(shù)優(yōu)勢

▶ 樣品類型廣泛：動植物組織、微生物、細(xì)胞、外泌體等
▶ 質(zhì)控嚴(yán)格：嚴(yán)格的質(zhì)量控制，及時與客戶溝通RNA質(zhì)檢結(jié)果
▶ 平臺優(yōu)，數(shù)據(jù)質(zhì)量高：基于優(yōu)質(zhì)的Illumina測序平臺，建庫成功率＞98%，數(shù)據(jù)質(zhì)量高，Q30＞85%
▶ 分析內(nèi)容豐富：個性化分析，聯(lián)合分析，分析內(nèi)容更豐富

參考文獻(xiàn)

1.Prediction of a peptidome for the ecotoxicological model Hyalella azteca (Crustacea; Amphipoda) using a de novo assembled transcriptome. Mar Genomics. 2018
無參轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)-端足蟲-通過對端足蟲轉(zhuǎn)錄組分析，為生態(tài)毒理研究奠定良好的基礎(chǔ)。
2.De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017
無參轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)-鯨魚-通過對灰鯨基因組和轉(zhuǎn)錄組分析，更好地了解鯨魚的進(jìn)化及其適應(yīng)低氧環(huán)境的機(jī)制。

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