精準(zhǔn)DNA甲基化/羥甲基化測(cè)序（oxBS-seq）

oxBS-seq

羥甲基化5hmC是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基，在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復(fù)雜疾病及腫瘤發(fā)生過程中起重要作用。

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最后更新：	2023-2-10	半年訪問：	33
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羥甲基化5hmC是哺乳動(dòng)物基因組上的第六堿基，在發(fā)育、衰老、神經(jīng)退行性疾病、復(fù)雜疾病及腫瘤發(fā)生過程中起重要作用。DNA羥甲基化是近年發(fā)現(xiàn)的一種新的DNA修飾并迅速成為研究熱點(diǎn)。隨著研究的深入，發(fā)現(xiàn)之前被認(rèn)為是檢測(cè)DNA甲基化標(biāo)準(zhǔn)的重亞硫酸鹽測(cè)序并不能區(qū)分DNA甲基化（5mC）和DNA羥甲基化（5hmC）。

易基因聯(lián)合劍橋大學(xué)建立了化學(xué)氧化法結(jié)合重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化的測(cè)序技術(shù)（oxidative bisulfite sequencing, oxBS-Seq），該技術(shù)不僅可以精確檢測(cè)DNA甲基化，排除DNA羥甲基化的影響，還可以雙文庫結(jié)合同時(shí)單堿基分辨率精確檢測(cè)DNA羥甲基化。

傳統(tǒng)BS轉(zhuǎn)化無法區(qū)分5mC和5hmC
傳統(tǒng)的Bisulfite測(cè)序中，5hmC經(jīng)過Bisulfite處理后變?yōu)镃MS，CMS在測(cè)序中仍然被讀作C堿基，因此不能區(qū)分5mC和5hmC。

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