N7-甲基鳥苷(N7-methylguanosine,m7G)是真核生物tRNA、rRNA和mRNA 5'cap中最豐富的修飾之一。作為一種重要的表觀遺傳修飾,m7G RNA甲基化在基因表達、加工代謝、蛋白質合成、轉錄穩(wěn)定等方面發(fā)揮著重要的作用,參與疾病發(fā)生發(fā)展等多種生命過程。
對于m7G RNA甲基化修飾的檢測,易基因采用基于抗體富集的m7G-MeRIP-seq,利用m7G特異性抗體富集發(fā)生m7G甲基化修飾的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),結合高通量測序,對RNA上的m7G修飾進行定位與定量,總RNA起始量可降低至10μg,最低僅需1μg總RNA。
技術優(yōu)勢:
- 起始量低:樣本起始量可降低至10-20μg,最低僅需1μg總RNA;
- 高通量測序:全轉錄組m7G位點高通量測序,可同時檢測mRNA和lncRNA;
- 樣本要求:可用于動物、植物、細胞及組織的m7G檢測;
- 重復性高:m7G-MeRIP-seq的IP富集重復性高,最大化降低抗體富集偏差;
- 應用范圍廣:廣泛應用于組織發(fā)育、干細胞自我更新和分化、熱休克或DNA損傷應答、癌癥的發(fā)生與發(fā)展、藥物應答等研究領域。
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深圳市易基因科技有限公司(簡稱易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引領表觀遺傳學科學研究與臨床應用”為愿景,依托高通量測序技術和云數(shù)據(jù)分析平臺。為醫(yī)療機構、科研機構、企事業(yè)單位等提供以表觀遺傳學技術為核心的多組學科研服務及解決方案,全面覆蓋針對生命科學基礎研究、醫(yī)學及臨床應用研究等內容。 易基因專注表觀組學十余年,領跑多組學科研服務。技術團隊在國際上首創(chuàng)LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羥甲基化技術流程,研發(fā)建立簡化基因組甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,單細胞/微量DNA全基因組甲基化及簡化高通量甲基化測序技術,RNA甲基化測序等技術和方法,并建立易基因科技全自動化彈性資源生信分析系統(tǒng)。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊發(fā)表論文100余篇,申請發(fā)明專利12項、軟件著作權27項。