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m1A RNA甲基化測序MeRIP-seq/m1A-seq
N1-甲基腺苷(N1-methyladenosine,m1A)是一種普遍存在于真核生物tRNA、rRNA和mRNA且可逆的轉(zhuǎn)錄后RNA修飾。
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N1-甲基腺苷(N1-methyladenosine,m1A)是一種普遍存在于真核生物tRNA、rRNA和mRNA且可逆的轉(zhuǎn)錄后RNA修飾;诟咄繙y序技術(shù)最新研究揭示m1A RNA修飾在基因調(diào)控和生物過程中的關(guān)鍵作用:對RNA穩(wěn)定性和翻譯起始等過程有著重要調(diào)節(jié)作用,廣泛參與多種疾病的發(fā)生和發(fā)展。
 
m1A RNA修飾的檢測,易基因采用基于抗體富集的甲基化RNA免疫沉淀測序方法(MeRIP-seq/m1A-seq),該技術(shù)利用m1A特異性抗體富集發(fā)生m1A修飾的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),結(jié)合高通量測序,對RNA上的m1A修飾進(jìn)行定位與定量,總RNA起始量可降低至10μg,最低僅需1μg總RNA。
 
易基因提供適用于不同科研需求的m1A-seq技術(shù):
  • m1A甲基化-常量mRNA 甲基化測序(m1A-seq)
  • m1A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化測序(lnc-m1A-seq)
  • m1A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序(Micro-lnc-m1A-seq)
技術(shù)優(yōu)勢:
  • 起始量低:樣本起始量可降低至10-20μg,最低僅需1μg總RNA;
  • 轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi):可以同時(shí)檢測mRNA和lncRNA;
  • 樣本要求:可用于動物、植物、細(xì)胞及組織的m1A檢測;
  • 重復(fù)性高:IP富集重復(fù)性高,最大化降低抗體富集偏差
  • 應(yīng)用范圍廣:廣泛應(yīng)用于組織發(fā)育、干細(xì)胞自我更新和分化、熱休克或DNA損傷應(yīng)答、癌癥的發(fā)生與發(fā)展、藥物應(yīng)答等研究領(lǐng)域。
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