N1-甲基腺苷(N1-methyladenosine,m1A)是一種普遍存在于真核生物tRNA、rRNA和mRNA且可逆的轉(zhuǎn)錄后RNA修飾;诟咄繙y序技術(shù)最新研究揭示m1A RNA修飾在基因調(diào)控和生物過程中的關(guān)鍵作用:對RNA穩(wěn)定性和翻譯起始等過程有著重要調(diào)節(jié)作用,廣泛參與多種疾病的發(fā)生和發(fā)展。
m1A RNA修飾的檢測,易基因采用基于抗體富集的甲基化RNA免疫沉淀測序方法(MeRIP-seq/m1A-seq),該技術(shù)利用m1A特異性抗體富集發(fā)生m1A修飾的RNA片段(包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA),結(jié)合高通量測序,對RNA上的m1A修飾進(jìn)行定位與定量,總RNA起始量可降低至10μg,最低僅需1μg總RNA。
易基因提供適用于不同科研需求的m1A-seq技術(shù):
- m1A甲基化-常量mRNA 甲基化測序(m1A-seq)
- m1A甲基化-常量mRNA +lncRNA甲基化測序(lnc-m1A-seq)
- m1A甲基化-微量mRNA +lncRNA甲基化測序(Micro-lnc-m1A-seq)
技術(shù)優(yōu)勢:
- 起始量低:樣本起始量可降低至10-20μg,最低僅需1μg總RNA;
- 轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi):可以同時(shí)檢測mRNA和lncRNA;
- 樣本要求:可用于動物、植物、細(xì)胞及組織的m1A檢測;
- 重復(fù)性高:IP富集重復(fù)性高,最大化降低抗體富集偏差
- 應(yīng)用范圍廣:廣泛應(yīng)用于組織發(fā)育、干細(xì)胞自我更新和分化、熱休克或DNA損傷應(yīng)答、癌癥的發(fā)生與發(fā)展、藥物應(yīng)答等研究領(lǐng)域。
bio-equip.com
深圳市易基因科技有限公司(簡稱易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引領(lǐng)表觀遺傳學(xué)科學(xué)研究與臨床應(yīng)用”為愿景,依托高通量測序技術(shù)和云數(shù)據(jù)分析平臺。為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科研機(jī)構(gòu)、企事業(yè)單位等提供以表觀遺傳學(xué)技術(shù)為核心的多組學(xué)科研服務(wù)及解決方案,全面覆蓋針對生命科學(xué)基礎(chǔ)研究、醫(yī)學(xué)及臨床應(yīng)用研究等內(nèi)容。 易基因?qū)W⒈碛^組學(xué)十余年,領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)。技術(shù)團(tuán)隊(duì)在國際上首創(chuàng)LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羥甲基化技術(shù)流程,研發(fā)建立簡化基因組甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,單細(xì)胞/微量DNA全基因組甲基化及簡化高通量甲基化測序技術(shù),RNA甲基化測序等技術(shù)和方法,并建立易基因科技全自動化彈性資源生信分析系統(tǒng)。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊發(fā)表論文100余篇,申請發(fā)明專利12項(xiàng)、軟件著作權(quán)27項(xiàng)。