與常規(guī)RRBS不同,高通量單細(xì)胞甲基化測(cè)序sc-RBS由于從單個(gè)細(xì)胞輸入的DNA量很少,常規(guī)方法不能保證目標(biāo)DNA在最后的擴(kuò)增過程中保持不變,因此sc-RBS在降損方面進(jìn)行細(xì)化。易基因建立的高通量單細(xì)胞甲基化測(cè)序sc-RBS技術(shù)無需純化,通過限制性內(nèi)切酶消化、接頭連接過程和在單管中轉(zhuǎn)化重亞硫酸鹽,是一種專注于將純化過程中發(fā)生的損失降至最低的方法。
應(yīng)用方向:
- 細(xì)胞發(fā)育:生殖細(xì)胞或胚胎細(xì)胞的成熟受到特定基因表達(dá)的影響,這與DNA中的甲基化水平相關(guān)。
- 疾病相關(guān)研究:在各種疾病中(尤其癌癥),具有正常細(xì)胞所不具有的DNA甲基化模式,從而導(dǎo)致基因表達(dá)水平的差異。
- 珍稀樣本:高通量單細(xì)胞甲基化測(cè)序特別適用于難以取得的珍稀樣本和細(xì)胞異質(zhì)性較大的組織樣本。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
- 起始量:?jiǎn)渭?xì)胞或1-10個(gè)細(xì)胞;
- 分辨率高:?jiǎn)螇A基分辨率;
- 細(xì)胞檢測(cè)通量高:可對(duì)上百成千個(gè)單細(xì)胞進(jìn)行甲基化檢測(cè)
- CG覆蓋位點(diǎn)高:CG位點(diǎn)覆蓋可達(dá)4-8M;
- 性價(jià)比高:?jiǎn)蝹(gè)細(xì)胞檢測(cè)費(fèi)用低至千余元。
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深圳市易基因科技有限公司(簡(jiǎn)稱易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引領(lǐng)表觀遺傳學(xué)科學(xué)研究與臨床應(yīng)用”為愿景,依托高通量測(cè)序技術(shù)和云數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科研機(jī)構(gòu)、企事業(yè)單位等提供以表觀遺傳學(xué)技術(shù)為核心的多組學(xué)科研服務(wù)及解決方案,全面覆蓋針對(duì)生命科學(xué)基礎(chǔ)研究、醫(yī)學(xué)及臨床應(yīng)用研究等內(nèi)容。 易基因?qū)W⒈碛^組學(xué)十余年,領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)。技術(shù)團(tuán)隊(duì)在國(guó)際上首創(chuàng)LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羥甲基化技術(shù)流程,研發(fā)建立簡(jiǎn)化基因組甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,單細(xì)胞/微量DNA全基因組甲基化及簡(jiǎn)化高通量甲基化測(cè)序技術(shù),RNA甲基化測(cè)序等技術(shù)和方法,并建立易基因科技全自動(dòng)化彈性資源生信分析系統(tǒng)。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊發(fā)表論文100余篇,申請(qǐng)發(fā)明專利12項(xiàng)、軟件著作權(quán)27項(xiàng)。