cfDNA片段化嚴(yán)重,片段大小常在150bp左右,現(xiàn)有甲基化檢測(cè)技術(shù)包括cfMeDIP和微量WGBS等。無(wú)法做到堿基分辨、具有抗體特異性和非特異性捕獲、覆蓋深度低、檢測(cè)成本高等特點(diǎn)。常規(guī)RRBS富集約70-350bp范圍酶切片段,如對(duì)于CG含量高的片段將被切割的更碎而無(wú)法檢測(cè),保留下來(lái)的片段反而是CG含量低,無(wú)甲基化信息的基因片段。
易基因研發(fā)cfDNA-RBS技術(shù),特異性捕獲CCGG位點(diǎn)兩端的DNA,通過(guò)亞硫酸鹽測(cè)序,實(shí)現(xiàn)高深度,單堿基分辨檢測(cè)CG位點(diǎn)甲基化信息。DNA起始量?jī)H需5ng,是目前腫瘤甲基化標(biāo)志物檢測(cè)研究的優(yōu)選技術(shù),應(yīng)用場(chǎng)景包括腫瘤早篩、腫瘤診斷、個(gè)性化用藥、實(shí)時(shí)監(jiān)控、預(yù)后監(jiān)測(cè)等。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
- 超低起始量:100-500ul血漿或5ng cfDNA;
- 測(cè)序覆蓋度高:20G測(cè)序數(shù)據(jù),可達(dá)10M的CG位點(diǎn)覆蓋,涵蓋CpG島、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、CTCF結(jié)合位點(diǎn)等多種核心調(diào)控區(qū)域
- 單堿基分辨率:在其覆蓋范圍內(nèi)可精確分析每一個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài);
- 性價(jià)比高:成本相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)大幅降低。
應(yīng)用場(chǎng)景:
- 癌前病變的癌變預(yù)警標(biāo)志物檢測(cè)
- 腫瘤早期篩查標(biāo)志物檢測(cè)
- 腫瘤預(yù)后標(biāo)志物檢測(cè)
- 藥物療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物檢測(cè)
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深圳市易基因科技有限公司(簡(jiǎn)稱易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引領(lǐng)表觀遺傳學(xué)科學(xué)研究與臨床應(yīng)用”為愿景,依托高通量測(cè)序技術(shù)和云數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科研機(jī)構(gòu)、企事業(yè)單位等提供以表觀遺傳學(xué)技術(shù)為核心的多組學(xué)科研服務(wù)及解決方案,全面覆蓋針對(duì)生命科學(xué)基礎(chǔ)研究、醫(yī)學(xué)及臨床應(yīng)用研究等內(nèi)容。 易基因?qū)W⒈碛^組學(xué)十余年,領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)。技術(shù)團(tuán)隊(duì)在國(guó)際上首創(chuàng)LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羥甲基化技術(shù)流程,研發(fā)建立簡(jiǎn)化基因組甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,單細(xì)胞/微量DNA全基因組甲基化及簡(jiǎn)化高通量甲基化測(cè)序技術(shù),RNA甲基化測(cè)序等技術(shù)和方法,并建立易基因科技全自動(dòng)化彈性資源生信分析系統(tǒng)。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊發(fā)表論文100余篇,申請(qǐng)發(fā)明專利12項(xiàng)、軟件著作權(quán)27項(xiàng)。