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微量cfDNA簡(jiǎn)化基因組甲基化測(cè)序(cfDNA-RBS)
cfDNA片段化嚴(yán)重,片段大小常在150bp左右,現(xiàn)有甲基化檢測(cè)技術(shù)包括cfMeDIP和微量WGBS等。
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):226
最后更新:2023-2-10半年訪問(wèn):30
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cfDNA片段化嚴(yán)重,片段大小常在150bp左右,現(xiàn)有甲基化檢測(cè)技術(shù)包括cfMeDIP和微量WGBS等。無(wú)法做到堿基分辨、具有抗體特異性和非特異性捕獲、覆蓋深度低、檢測(cè)成本高等特點(diǎn)。常規(guī)RRBS富集約70-350bp范圍酶切片段,如對(duì)于CG含量高的片段將被切割的更碎而無(wú)法檢測(cè),保留下來(lái)的片段反而是CG含量低,無(wú)甲基化信息的基因片段。
 
易基因研發(fā)cfDNA-RBS技術(shù),特異性捕獲CCGG位點(diǎn)兩端的DNA,通過(guò)亞硫酸鹽測(cè)序,實(shí)現(xiàn)高深度,單堿基分辨檢測(cè)CG位點(diǎn)甲基化信息。DNA起始量?jī)H需5ng,是目前腫瘤甲基化標(biāo)志物檢測(cè)研究的優(yōu)選技術(shù),應(yīng)用場(chǎng)景包括腫瘤早篩、腫瘤診斷、個(gè)性化用藥、實(shí)時(shí)監(jiān)控、預(yù)后監(jiān)測(cè)等。
 
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
  • 超低起始量:100-500ul血漿或5ng cfDNA;
  • 測(cè)序覆蓋度高:20G測(cè)序數(shù)據(jù),可達(dá)10M的CG位點(diǎn)覆蓋,涵蓋CpG島、啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、CTCF結(jié)合位點(diǎn)等多種核心調(diào)控區(qū)域
  • 單堿基分辨率:在其覆蓋范圍內(nèi)可精確分析每一個(gè)C堿基的甲基化狀態(tài);
  • 性價(jià)比高:成本相對(duì)于現(xiàn)有技術(shù)大幅降低。
 
應(yīng)用場(chǎng)景:
  • 癌前病變的癌變預(yù)警標(biāo)志物檢測(cè)
  • 腫瘤早期篩查標(biāo)志物檢測(cè)
  • 腫瘤預(yù)后標(biāo)志物檢測(cè)
  • 藥物療效預(yù)測(cè)標(biāo)志物檢測(cè)
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