單細(xì)胞及微量樣本的DNA甲基化組學(xué)研究很大程度上受制于建庫技術(shù)。傳統(tǒng)的文庫構(gòu)建方法或類似于基因組DNA的單細(xì)胞擴(kuò)增技術(shù)很難應(yīng)用到甲基化實(shí)驗(yàn)過程中。易基因建立了一系列微量及單細(xì)胞甲基化檢測(cè)方法,可對(duì)于不同項(xiàng)目需求,個(gè)性化提供檢測(cè)方案,在全基因組、簡(jiǎn)化基因組、靶基因等范圍開展甲基化檢測(cè)。
易基因建立的單細(xì)胞及微量樣本DNA甲基化測(cè)序技術(shù)包括:
- 單細(xì)胞全基因組甲基化測(cè)序(scWGBS)
- 單細(xì)胞簡(jiǎn)化基因組甲基化測(cè)序(scXRBS)
- 微量樣本全基因組甲基化測(cè)序(Micro DNA-WGBS)
- 微量細(xì)胞或DNA簡(jiǎn)化基因組甲基化測(cè)序(Micro DNA-XRBS)
應(yīng)用方向:
單細(xì)胞及微量珍稀樣本的甲基化研究主要應(yīng)用于腫瘤發(fā)生機(jī)制,癌癥研究,胚胎植入前診斷,胚胎早期發(fā)育,生殖細(xì)胞重組,干細(xì)胞及細(xì)胞異質(zhì)性等研究領(lǐng)域。應(yīng)用的樣本包括單細(xì)胞、微量細(xì)胞、微量DNA等。特別適用于難以取得的珍稀樣本和細(xì)胞異質(zhì)性較大的組織樣本。
技術(shù)優(yōu)勢(shì):
1)微量細(xì)胞或單細(xì)胞全基因組甲基化測(cè)序(Micro DNA-WGBS)DNA起始量:
單細(xì)胞/100-1000個(gè)細(xì)胞
1ng基因組DNA
90%以上基因組CG覆蓋
2)微量細(xì)胞或DNA簡(jiǎn)化基因組甲基化測(cè)序(Micro DNA-XRBS)DNA起始量:
1ng基因組DNA;
10-20M有效CG位點(diǎn)覆蓋;
20G測(cè)序數(shù)據(jù)量。
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深圳市易基因科技有限公司(簡(jiǎn)稱易基因,E-GENE Co.,Ltd.)以“引領(lǐng)表觀遺傳學(xué)科學(xué)研究與臨床應(yīng)用”為愿景,依托高通量測(cè)序技術(shù)和云數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科研機(jī)構(gòu)、企事業(yè)單位等提供以表觀遺傳學(xué)技術(shù)為核心的多組學(xué)科研服務(wù)及解決方案,全面覆蓋針對(duì)生命科學(xué)基礎(chǔ)研究、醫(yī)學(xué)及臨床應(yīng)用研究等內(nèi)容。 易基因?qū)W⒈碛^組學(xué)十余年,領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)。技術(shù)團(tuán)隊(duì)在國際上首創(chuàng)LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羥甲基化技術(shù)流程,研發(fā)建立簡(jiǎn)化基因組甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,單細(xì)胞/微量DNA全基因組甲基化及簡(jiǎn)化高通量甲基化測(cè)序技術(shù),RNA甲基化測(cè)序等技術(shù)和方法,并建立易基因科技全自動(dòng)化彈性資源生信分析系統(tǒng)。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等著名期刊發(fā)表論文100余篇,申請(qǐng)發(fā)明專利12項(xiàng)、軟件著作權(quán)27項(xiàng)。