SNP基因分型
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SNP(single nucleotide polymorphism),即單核苷酸多態(tài)性,是由于單個核苷酸改變而導致的核酸序列多態(tài)。一般來說,一個SNP位點只有兩種等位基因,因此又叫雙等位基因。
SNP絕大多數(shù)位于非編碼區(qū),多為轉(zhuǎn)換,即一種嘧啶堿基換為另一種嘧啶堿基,或一種嘌呤堿基換為另一種嘌呤堿基,轉(zhuǎn)換與顛換之比為2:1。SNP在CG序列上出現(xiàn)最為頻繁,而且多是C→T,因為CG中C即胞嘧啶常被甲基化,自發(fā)脫氨后即變?yōu)樾叵汆奏ぁ?/p>
SNP在人類基因組中的發(fā)生頻率比較高,大約平均每1000個堿基中就有一個多態(tài)位點。有些SNP位點還會影響基因的功能,導致生物性狀改變甚至致病。單核苷酸多態(tài)性是繼RFLP (限制性片段長度多態(tài)性)和小衛(wèi)星DNA重復序列、微衛(wèi)星DNA重復序列后的第三代DNA水平遺傳多態(tài)性標記,是研究人類家族和動植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被廣泛用于群體遺傳學研究(如生物的起源、進化及遷移等方面)和疾病相關基因的研究,在藥物基因組學、診斷學和生物醫(yī)學研究中起重要作用。