高通量測(cè)序服務(wù)

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solexa實(shí)驗(yàn)方案

  敏芯測(cè)序平臺(tái)包括：

1、基因組測(cè)序與重測(cè)序
2、數(shù)字表達(dá)譜分析
3、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
4、小RNA測(cè)序
5、ChIP-Seq
6、宏基因組測(cè)序（Meta-Genomics DNA測(cè)序）

＊ 實(shí)驗(yàn)步驟:  （以tag profiling測(cè)序?yàn)槔��?br />
      對(duì)客戶提供的mRNA(或總RNA)進(jìn)行樣品檢測(cè)，樣品檢測(cè)合格后采取如下技術(shù)路線進(jìn)行測(cè)序： 
      基因表達(dá)方法采用Illumina Digital Gene Expression試劑盒。選取起始1～2μg總RNA，利用OligodT的beads富集總RNA樣本中mRNA，并逆轉(zhuǎn)錄為雙鏈cDNA，采用4堿基識(shí)別酶DpnII酶切雙鏈cDNA，鏈接Illumina adapter1，利用MmeI酶切3’端20堿基，并在3’端鏈接Illumina adapter2。 
    再加入Primer GX1和Primer GX2, 進(jìn)行15個(gè)循環(huán)的PCR擴(kuò)增（10 seconds at 98°C， 30 seconds at 60°C， 15 seconds at 72°C ，10 minutes at 72°C）。擴(kuò)增后樣本通過6% TBE PAGE膠回收85堿基條帶，純化后通過Illumina基因表達(dá)測(cè)序法測(cè)序。 

＊ 技術(shù)參數(shù)： 

每個(gè)通道，測(cè)序片段35個(gè)bp。 
保證測(cè)量500萬Read。 
簡(jiǎn)單的數(shù)據(jù)分析： 
1）、Reads數(shù)目統(tǒng)計(jì)及頻率分布圖，將Reads比對(duì)到參考基因、基因組。 
2）、Reads在所有已知的參考基因中的位置分布情況。 
3）、不同長(zhǎng)度的所有已知的miRNA基因被Reads覆蓋的情況。 
進(jìn)一步的數(shù)據(jù)分析參見詳細(xì)數(shù)據(jù)分析方案。 

所有解釋權(quán)歸上海敏芯信息科技有限公司所有；根據(jù)客戶的要求可以繼續(xù)進(jìn)行其他的深入分析。