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SNP分型業(yè)務(wù)
SNP分型服務(wù)應(yīng)用連接酶特異檢測(cè)反應(yīng)(LDR)技術(shù),即當(dāng)兩條寡核苷酸與互補(bǔ)靶DNA完全配對(duì)時(shí),連接反應(yīng)才能順利進(jìn)行,否則連接反應(yīng)不能進(jìn)行的原理,實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP 位點(diǎn)的檢測(cè)。
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):2065
最后更新:2009-12-29半年訪問(wèn):22
參考報(bào)價(jià):詢價(jià)025-83607783/83607782
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服務(wù)商: 南京圣比澳生物科技有限公司 查看該公司所有服務(wù) >>
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目前主要應(yīng)用領(lǐng)域
復(fù)雜疾病的易感性基因分析與基因定位
環(huán)境因子易感基因的檢出與病原體基因分析
藥物開(kāi)發(fā)與個(gè)體用藥
個(gè)體識(shí)別與法醫(yī)鑒定
系統(tǒng)發(fā)育分析與病理分子遺傳機(jī)理的闡明
生物進(jìn)化與遺傳分析


主要服務(wù)方案
SNP分型服務(wù)主要利用連接酶特異檢測(cè)技術(shù),對(duì)需檢測(cè)SNP位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性探針,在連接酶的作用下,當(dāng)特異性的寡核苷酸探針與互補(bǔ)靶序列DNA完全配對(duì)時(shí)連接反應(yīng)順利進(jìn)行,若寡核苷酸探針與其不完全配對(duì),則連接反應(yīng)不能進(jìn)行。最后通過(guò)測(cè)序儀檢測(cè),得到分型結(jié)果。



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核心技術(shù):

多重PCR
多重LDR
Megabace 電泳檢測(cè)
原理示意圖:




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服務(wù)流程
分型樣品的要求:

1、若分型樣品為基因組DNA或質(zhì)粒DNA ,樣品要求:DNA濃度≥5ng/ul,體積≥10ul,純度 OD 260/280 在1.7~1.9之間。如果客戶要求提供樣品純化服務(wù),我們對(duì)每個(gè)樣品將收取10元純化費(fèi)。
2、若分型樣品為基因組DNA,樣品要求:DNA濃度≥5ng/ul,體積≥10ul,純度 OD 260/280 在1.7~1.9之間。如果客戶要求提供樣品純化服務(wù),我們將對(duì)每個(gè)樣品收取10元純化費(fèi)。
3、客戶每次在運(yùn)送樣品的時(shí)候,應(yīng)在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少的運(yùn)輸過(guò)程中因溫度變化導(dǎo)致樣品變質(zhì)的可能。請(qǐng)?jiān)诿看渭某鰳悠泛蠹皶r(shí)與本公司分型部聯(lián)系,可以E-mail或者傳真的方式告知樣品的詳細(xì)信息,以便我們?cè)谑盏綐悠泛竽芗皶r(shí)與您進(jìn)行溝通確認(rèn)。
4、我們將自收到客戶樣品之日起2個(gè)工作日內(nèi),對(duì)客戶樣品進(jìn)行核查,如樣品在接受過(guò)程中發(fā)現(xiàn)異常情況,或若經(jīng)過(guò)質(zhì)檢,發(fā)現(xiàn)樣品不符合我們的檢測(cè)要求,都將及時(shí)與客戶聯(lián)系,由客戶重新提供合格樣品。
5、我們?cè)谔峁﹩魏塑账岫鄳B(tài)性(SNP)分型服務(wù)的過(guò)程中,會(huì)妥善保管您提供的所有樣本和樣本信息,以免丟失、缺少、變質(zhì)或污染,當(dāng)實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,我們會(huì)將所有剩余樣本全部送還給您,或按照您的要求妥善處理。
6、我們與客戶簽訂服務(wù)協(xié)議后,自樣品移交之日起,我們承諾將對(duì)客戶的樣品承擔(dān)妥善保管和因?qū)嶒?yàn)需要而合理使用的義務(wù),對(duì)于實(shí)驗(yàn)過(guò)程中的樣品損耗(包括實(shí)驗(yàn)失敗造成的樣品損耗)以及由此可能帶來(lái)的相關(guān)問(wèn)題(如實(shí)驗(yàn)終止、實(shí)驗(yàn)方案調(diào)整、重新準(zhǔn)備樣品等),我們不承擔(dān)任何賠償責(zé)任。

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客戶將得到的數(shù)據(jù)
不斷發(fā)展,不斷完善
1.SNPs結(jié)果(ExceL表格);
2.實(shí)驗(yàn)過(guò)程中涉及的電泳圖,測(cè)序峰型圖(見(jiàn)下樣圖);
3.擴(kuò)增和反應(yīng)體系所涉及的引物序列;
4.客戶所需的其它資料。



為滿足客戶大批量樣品檢測(cè)的要求,公司正在引進(jìn)高通量SNPlex技術(shù),SNPlexGenotyping System 是基于熒光檢測(cè)方法來(lái)進(jìn)行的,其檢測(cè)原理:DNA模板直接與一套3個(gè)探針組成的系統(tǒng)結(jié)合,這3個(gè)探針包括2個(gè)等位基因特異性探針(ASO探針)和一個(gè)位點(diǎn)特異性探針(LSO探針);當(dāng)ASO探針和LSO探針與模板完全匹配時(shí),連接酶連接兩條探針。然后,使用生物素標(biāo)記的PCR引物擴(kuò)增該連接產(chǎn)物。生物素標(biāo)記的擴(kuò)增產(chǎn)物結(jié)合在鏈霉親和素包被的雜交板孔中,通過(guò)堿變性的方法使生物素標(biāo)記的單鏈PCR產(chǎn)物保留在雜交板中,然后該單鏈PCR產(chǎn)物的特殊部位與一套通用Zipchute探針雜交結(jié)合。這些探針帶有熒光標(biāo)記,它們具有特殊的片段與單鏈PCR產(chǎn)物的特殊部位互補(bǔ),還包括有修飾部分,一條Zipchute探針對(duì)應(yīng)一個(gè)待檢測(cè)等位基因。然后將雜交捕獲到的Zipchute探針?lè)蛛x出來(lái),通過(guò)毛細(xì)管電泳進(jìn)行檢測(cè),最后通過(guò)GeneMapper軟件分析來(lái)確定SNP的基因型。

此方法具有檢測(cè)通量高、分型快、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)靈活、在實(shí)驗(yàn)應(yīng)用中可升級(jí)空間大等優(yōu)點(diǎn)。

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