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Sanger測(cè)序服務(wù)——小基因組Shotgun測(cè)序
全長(zhǎng)Shotgun測(cè)序 大片段全長(zhǎng)鳥(niǎo)槍法測(cè)序
服務(wù)類(lèi)別:測(cè)序/合成總訪(fǎng)問(wèn):4053
最后更新:2015-7-14半年訪(fǎng)問(wèn):30
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Sanger測(cè)序服務(wù)——小基因組Shotgun測(cè)序

詳細(xì)描述:
鳥(niǎo)槍?xiě)?zhàn)略(Shotgun Strategy)又稱(chēng)隨機(jī)測(cè)序戰(zhàn)略,是由美國(guó)塞萊拉遺傳公司創(chuàng)始人克雷格·文特爾發(fā)明,主要針對(duì)大片段的全長(zhǎng)測(cè)序。此策略是將基因組DNA用機(jī)械方法隨機(jī)打斷成小片段,并連入合適的載體構(gòu)建亞克隆文庫(kù),從中隨機(jī)挑取克隆測(cè)序,再通過(guò)生物信息學(xué)方法對(duì)測(cè)得的序列進(jìn)行拼接組裝以獲得大片段DNA的序列。
構(gòu)建不同插入片段大小的Shotgun文庫(kù)(1.5~3 Kb、4~6 Kb、6~8 Kb等),可減少因基因組中的重復(fù)序列造成的錯(cuò)誤拼裝,提供更多Contigs之間的關(guān)聯(lián)信息。Shotgun策略已廣泛應(yīng)用于包括基因組、葉綠體、線(xiàn)粒體、野生質(zhì)粒、噬菌體、病毒以及Fosmid/Cosmid/BAC克隆等的全長(zhǎng)測(cè)序。


 

BAC全長(zhǎng)測(cè)序流程圖
 
美吉優(yōu)勢(shì)
1. 成熟的Shotgun文庫(kù)構(gòu)建體系,確保您在最短時(shí)間拿到數(shù)據(jù)    我們?cè)鴦?chuàng)造了10個(gè)工作日完成40 Kb Fosmid全長(zhǎng)測(cè)序的記錄。
2. 專(zhuān)業(yè)的生物信息團(tuán)隊(duì)    能提供可靠精準(zhǔn)的序列拼接結(jié)果,8~10倍覆蓋率,phred-20質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),全長(zhǎng)準(zhǔn)確率大于99.99%,并可提供專(zhuān)業(yè)的生物信息分析。
3. 豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)    目前已成功完成了包括鏈霉菌、水稻、番茄、揚(yáng)子鱷、熊貓、朱鹮等物種的Fosmid/BAC克隆全長(zhǎng)測(cè)序1000余例,小鼠、蚯蚓、油菜花、大豆等物種的線(xiàn)粒體100余例,大腸桿菌的野生質(zhì)粒、噬菌體、病毒等全長(zhǎng)測(cè)序20余例。我們所提供的全長(zhǎng)序列已被眾多實(shí)驗(yàn)室用于發(fā)表學(xué)術(shù)論文。
 
收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)

樣品來(lái)源
內(nèi)容
技術(shù)指標(biāo)
價(jià)格
Fosmid/Cosmid
全長(zhǎng)
測(cè)序
獲得大片段DNA全序列;無(wú)Gap;測(cè)序覆蓋率8~10倍;單堿基準(zhǔn)確率99.99%以上。
0.6元/bp,插入片段<25Kb時(shí),載體序列折半收費(fèi)
BAC
0.6元/bp
葉綠體、線(xiàn)粒體、病毒、噬菌體
0.8元/bp
其他大片段樣品
0.6元/bp,最低8000元

 
提供結(jié)果
完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告(包含實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)、質(zhì)控點(diǎn)、數(shù)據(jù)拼接記錄和完整序列)。

 

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