Sanger測(cè)序服務(wù)——小基因組Shotgun測(cè)序
詳細(xì)描述:
鳥(niǎo)槍?xiě)?zhàn)略(Shotgun Strategy)又稱(chēng)隨機(jī)測(cè)序戰(zhàn)略,是由美國(guó)塞萊拉遺傳公司創(chuàng)始人克雷格·文特爾發(fā)明,主要針對(duì)大片段的全長(zhǎng)測(cè)序。此策略是將基因組DNA用機(jī)械方法隨機(jī)打斷成小片段,并連入合適的載體構(gòu)建亞克隆文庫(kù),從中隨機(jī)挑取克隆測(cè)序,再通過(guò)生物信息學(xué)方法對(duì)測(cè)得的序列進(jìn)行拼接組裝以獲得大片段DNA的序列。
構(gòu)建不同插入片段大小的Shotgun文庫(kù)(1.5~3 Kb、4~6 Kb、6~8 Kb等),可減少因基因組中的重復(fù)序列造成的錯(cuò)誤拼裝,提供更多Contigs之間的關(guān)聯(lián)信息。Shotgun策略已廣泛應(yīng)用于包括基因組、葉綠體、線(xiàn)粒體、野生質(zhì)粒、噬菌體、病毒以及Fosmid/Cosmid/BAC克隆等的全長(zhǎng)測(cè)序。
BAC全長(zhǎng)測(cè)序流程圖
美吉優(yōu)勢(shì)
1. 成熟的Shotgun文庫(kù)構(gòu)建體系,確保您在最短時(shí)間拿到數(shù)據(jù) 我們?cè)鴦?chuàng)造了10個(gè)工作日完成40 Kb Fosmid全長(zhǎng)測(cè)序的記錄。
2. 專(zhuān)業(yè)的生物信息團(tuán)隊(duì) 能提供可靠精準(zhǔn)的序列拼接結(jié)果,8~10倍覆蓋率,phred-20質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),全長(zhǎng)準(zhǔn)確率大于99.99%,并可提供專(zhuān)業(yè)的生物信息分析。
3. 豐富的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn) 目前已成功完成了包括鏈霉菌、水稻、番茄、揚(yáng)子鱷、熊貓、朱鹮等物種的Fosmid/BAC克隆全長(zhǎng)測(cè)序1000余例,小鼠、蚯蚓、油菜花、大豆等物種的線(xiàn)粒體100余例,大腸桿菌的野生質(zhì)粒、噬菌體、病毒等全長(zhǎng)測(cè)序20余例。我們所提供的全長(zhǎng)序列已被眾多實(shí)驗(yàn)室用于發(fā)表學(xué)術(shù)論文。
收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)
樣品來(lái)源
|
內(nèi)容
|
技術(shù)指標(biāo)
|
價(jià)格
|
Fosmid/Cosmid
|
全長(zhǎng)
測(cè)序
|
獲得大片段DNA全序列;無(wú)Gap;測(cè)序覆蓋率8~10倍;單堿基準(zhǔn)確率99.99%以上。
|
0.6元/bp,插入片段<25Kb時(shí),載體序列折半收費(fèi)
|
BAC
|
0.6元/bp
|
葉綠體、線(xiàn)粒體、病毒、噬菌體
|
0.8元/bp
|
其他大片段樣品
|
0.6元/bp,最低8000元
|
提供結(jié)果
完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告(包含實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)、質(zhì)控點(diǎn)、數(shù)據(jù)拼接記錄和完整序列)。
bio-equip.com
上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司專(zhuān)注于新一代DNA高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發(fā)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,是上海張江高科技園區(qū)、張江藥谷重點(diǎn)支持企業(yè),華東師范大學(xué)戰(zhàn)略合作單位。目前,美吉生物在上海、北京、廣州三個(gè)一線(xiàn)城市建立了實(shí)驗(yàn)基地,銷(xiāo)售網(wǎng)絡(luò)遍布全國(guó)各地。
美吉生物擁有世界一流的測(cè)序平臺(tái),在ABI3730xl常規(guī)測(cè)序平臺(tái)的基礎(chǔ)上,先后引進(jìn)了羅氏454高通量測(cè)序平臺(tái)和Illumina高通量測(cè)序平臺(tái),專(zhuān)業(yè)提供動(dòng)植物基因組測(cè)序、微生物基因組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、小RNA測(cè)序、基因表達(dá)譜分析等技術(shù)服務(wù)。
美吉生物擁有一支實(shí)力雄厚的技術(shù)團(tuán)隊(duì),有從事分子生物學(xué)研究十多年、經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)骨干,也有創(chuàng)新進(jìn)取、拼勁十足的希望之星。技術(shù)團(tuán)隊(duì)經(jīng)驗(yàn)豐富,曾參與水稻、番茄、家蠶等多項(xiàng)大型基因組學(xué)項(xiàng)目,可以為您提供專(zhuān)業(yè)、合理、高性?xún)r(jià)比的實(shí)驗(yàn)方案。
生物信息學(xué)是國(guó)際前沿的新興學(xué)科,近年來(lái)發(fā)展迅猛。美吉生物擁有一支具有國(guó)際一流水平的生物信息分析團(tuán)隊(duì),不僅可以提供標(biāo)準(zhǔn)流程化的生物信息分析,還可以根據(jù)不同的課題需求,提供個(gè)性化的深度數(shù)據(jù)挖掘。
B2B(Bench to Bedside)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)模式,大大縮短了醫(yī)學(xué)科學(xué)從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的時(shí)間,加速了人類(lèi)進(jìn)入基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的步伐;趯(duì)未來(lái)醫(yī)學(xué)發(fā)展趨勢(shì)的充分理解,美吉生物和國(guó)內(nèi)多家著名三甲醫(yī)院聯(lián)合建立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心,開(kāi)展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,以迎接基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的到來(lái)。
美吉生物秉承“專(zhuān)業(yè)、卓越”的企業(yè)理念,“以客戶(hù)為本,讓客戶(hù)滿(mǎn)意”的服務(wù)宗旨,一如既往地致力于提供高品質(zhì)、高效率的技術(shù)服務(wù),努力將公司打造成為國(guó)內(nèi)一流企業(yè)。因?yàn)榫礃I(yè),所以專(zhuān)業(yè);因?yàn)閷?zhuān)業(yè),所以選擇;選擇美吉,選擇滿(mǎn)意!