羅氏FFPET組織樣本抽提RNA試劑盒實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
瀏覽次數(shù):6350 發(fā)布日期:2015-2-28
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High Pure FFPET RNA Isolation Kit基于離心柱法的抽提原理,在柱上直接進(jìn)行高效DNase消化,在整合的實(shí)驗(yàn)流程中方便地去除殘留DNA。 |
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圖1:抽提獲得寬泛的RNA片段范圍,F(xiàn)FPET RNA抽提物片段長(zhǎng)度范圍在100-4000bp
使用3中不同的方法從乳腺癌組織的5um FFPET樣品中抽提總RNA。綠色線顯示了使用該方法抽提獲得的RNA長(zhǎng)片段極少,以RNA降解片段為主;疑顯示的RNA抽提物覆蓋的片段范圍較廣,但在短片段RNA的分布存在較大的偏倚性。
結(jié)果:羅氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit的抽提產(chǎn)物(藍(lán)色線)較均勻地覆蓋了整個(gè)片段分布范圍。 |
圖2:從近期和長(zhǎng)期保存的FFPET樣品中均可抽提獲得高RNA得率 | |
A)柱形圖顯示了從結(jié)腸癌組織和正常結(jié)締組織10um FFPET切片樣本中抽提獲得的RNA平均得率(n=24)樣本保存時(shí)間分別為<6個(gè)月和>5年。 結(jié)果:羅氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit能獲得更高得率的RNA抽提產(chǎn)物。 B)顯示了圖A的最左側(cè)兩列柱狀圖,其24個(gè)重復(fù)樣本各自的RNA得率。24個(gè)重復(fù)樣本來(lái)自于組織的連續(xù)切片,以避免來(lái)自不同組織區(qū)域的核酸含量差異。 結(jié)果:在常規(guī)研究中,同一組織樣本的不同F(xiàn)FPET切片的核酸得率存在差異。但對(duì)于同一種樣本,羅氏High Pure FFPET RNA Isolation Kit始終能獲得更高得率的RNA抽提產(chǎn)物。 |
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圖3:從樣品中抽提獲得高質(zhì)量的RNA,提高RT-aPCR檢測(cè)靈敏度。
作為qPCR實(shí)驗(yàn)中的核酸模板,要求高質(zhì)量的RNA,即良好的核酸得率、純度和片段大小分布,并能高靈敏度和不偏倚地檢測(cè)模板基因的表達(dá)情況。
從3中不同異種移植物切片組織中抽提RNA,取150ng總RNA,使用Transcriptor Universal cDNA Master進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng),取10ng cDNA產(chǎn)物通過(guò)LightCycler 480 Real-Time PCR Instrument擴(kuò)增檢測(cè)ALAST基因表達(dá)情況。
結(jié)果:High Pure FFPET RNA Isolation Kit抽提獲得的RNA模板(n=8)能在RT-qPCR實(shí)驗(yàn)中獲得更高的檢測(cè)靈敏度。 | |
產(chǎn)品信息 |
產(chǎn)品 |
目錄號(hào) |
包裝規(guī)格 |
High Pure FFPET RNA Isolation Kit |
06 650 775 001 |
50次抽提反應(yīng) | |
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