KAPA HyperChoice探針在200Mb的人類基因組區(qū)域定制的應(yīng)用

 

 

 

 

KAPA HyperChoice / KAPA HyperExplore 定制設(shè)計(jì)

KAPA HyperChoice探針支持高達(dá)200 Mb的人類基因組區(qū)域定制， KAPA HyperExplore探針支持高達(dá)200 Mb的非人類基因組或復(fù)雜區(qū)域的定制。羅氏久經(jīng)驗(yàn)證的專有算法，加上我們?cè)谔结樑挪己驮O(shè)計(jì)領(lǐng)域近20年的經(jīng)驗(yàn)積累，能幫您解鎖基因組困難區(qū)域。結(jié)合優(yōu)化的KAPA HyperCap工作流程V3.0，KAPA靶向富集探針可大大提高捕獲均一性，并減少有效識(shí)別基因組變異所需的測(cè)序數(shù)據(jù)量。

 

 

精益設(shè)計(jì)

 

 

高性能KAPA靶向富集探針，快速、高效地覆蓋目標(biāo)區(qū)域

• 依靠羅氏專有算法和久經(jīng)驗(yàn)證的探針排布及設(shè)計(jì)，改善目標(biāo)覆蓋度，提高測(cè)序效率，使樣本數(shù)據(jù)利用最大化。

• 支持上傳基因名稱和bed文件，手動(dòng)輸入基因組坐標(biāo)，或從常用基因名列表中進(jìn)行選擇。

羅氏設(shè)計(jì)專家在線指導(dǎo)和支持

• 有關(guān)您的特殊設(shè)計(jì)需求或非人類物種定制，羅氏專業(yè)設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)將為您提供專屬服務(wù)。我們的設(shè)計(jì)專家將傾聽您的需求， 以優(yōu)化您的探針設(shè)計(jì)和選擇。

僅需幾步，理想設(shè)計(jì)唾手可得

• 羅氏的專業(yè)設(shè)計(jì)能力、卓越的高保真探針合成工藝、優(yōu)化的KAPA HyperCap工作流程，是您從第一次設(shè)計(jì)開始就能體驗(yàn)到的高品質(zhì)產(chǎn)品與服務(wù)。

 

 

KAPA HyperChoice / KAPA HyperExplore 定制設(shè)計(jì)探針

• 使用KAPA高保真聚合酶合成，經(jīng)羅氏專有算法設(shè)計(jì)。

• 基于NGS方法的質(zhì)量控制體系，保證質(zhì)量穩(wěn)定。

• 更高的均一性和更低PCR重復(fù)率，達(dá)到更好的目標(biāo)區(qū)域覆蓋

 

 

圖1. 未經(jīng)優(yōu)化的KAPA靶向富集探針，性能已然優(yōu)于SeqCap EZ Prime探針。對(duì)比試驗(yàn)中，兩種方法均依照各自的標(biāo)準(zhǔn)HyperCap Workflow操作指南，樣本使用coriell DNA。每個(gè)捕獲反應(yīng)混合8個(gè)DNA文庫，并根據(jù)panel大小在MiSeq系統(tǒng)上以2 x 100 bp測(cè)序。為了同等比較兩種不同技術(shù)的性能，HyperChoice Panel根據(jù)SeqCap EZ Neurodegenerative進(jìn)行設(shè)計(jì)，但并沒有像SeqCap EZ panel那樣經(jīng)過優(yōu)化。結(jié)果表明，KAPA HyperChoice探針以更高的均一性和更好的目標(biāo)區(qū)域覆蓋度超出SeqCap EZ版本探針。

 

 

在NovaSeq6000系統(tǒng)測(cè)序，結(jié)果顯示出非常低的PCR重復(fù)率，高均一性（Fold80低）和高目標(biāo)區(qū)域覆蓋（≥30X堿基覆蓋率）。兩種設(shè)計(jì)均按照KAPA HyperCap Workflow v3.0，樣本為100 ng NA12891 DNA。數(shù)據(jù)指標(biāo)為6個(gè)重復(fù)，單樣本捕獲的平均值

 

 

默瑞生物

 

 

默瑞(上海)生物科技有限公司，作為專業(yè)的生命科學(xué)產(chǎn)品推廣與服務(wù)商，以“創(chuàng)新，專業(yè)，共贏”的理念，不斷強(qiáng)化服務(wù)體系，提升客戶體驗(yàn)，以莫納生物產(chǎn)品為主線，結(jié)合國內(nèi)外優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品提供高標(biāo)準(zhǔn)完整解決方案，幫助科研客戶和生物技術(shù)企業(yè)高效創(chuàng)新，加速轉(zhuǎn)化，創(chuàng)造更多優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品，提升社會(huì)福祉，實(shí)現(xiàn)多方共贏。

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