由重慶醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院的Wanqian Li發(fā)表的名為“iPSC-based model of Vogt-Koyanagi-Harada disease for phenotype recapitulation and drug screening”的論文中,研究人員通過虛擬篩選從ChemBridge的化合物數(shù)據(jù)庫中篩選獲得了全新的能夠改善Vogt-小柳-原田綜合征的抑制劑。
AbMole(奧默生物)是ChemBridge在中國的唯一官方指定合作伙伴。
研究者首先對ChemBridge虛擬篩選化合物庫的1390000個化合物進行分子對接高通量虛擬篩選,找到了417000個可能結合的化合物。然后對該系列化合物,在標準精度模式下進行篩選,評分前200的化合物作為潛在的激動劑繼續(xù)進入下一階段。隨后,研究者綜合了結合模式、藥物化性和可用性等指標,篩選出50個化合物。最后根據(jù)Lipinski’s 規(guī)則,選出了三個候選化合物。
圖1:新型EGR2激動劑篩選流程。
隨后,研究者通過分子對接預測了這三種化合物與EGR2蛋白的結合方式,結果顯示,這三種化合物對EGR2蛋白均有很好的結合。
圖2:三個候選化合物的分子對接模擬EGR2蛋白結合結果。
為了驗證這些化合物具有EGR2的激動活性,研究者進行了進一步實驗,從mRNA水平在Vogt-小柳-原田綜合征(VHK)模型中觀察三個候選化合物的活性。實驗發(fā)現(xiàn):化合物CQMU98能夠顯著增加EGR2的表達水平,有最好的激動活性。
圖3:三個候選化合物的分子對EGR2的mRNA水平影響。
最后,研究者在EGR2蛋白水平以及細胞自噬兩個水平上對化合物CQMU98進行評價,結果顯示,CQMU98化合物能將VHK模型中下調的蛋白回復到正常水平,并且增加了細胞自噬,幫助細胞清除異常物質。
圖4:CQMU98調控Vogt-小柳-原田綜合征蛋白并促進細胞自噬。
在本研究中,研究者提出EGR2激動劑在改善Vogt-小柳-原田綜合征中的應用價值。隨后,研究者進行物虛擬篩選,通過對多個指標的綜合評價并從ChemBridge虛擬篩選數(shù)據(jù)庫中篩選出一系列新型EGR2激動劑,并從mRNA水平檢測了這些激動劑的活性,結果顯示CQMU98的活性最強。最后,研究者發(fā)現(xiàn)CQMU98能夠從蛋白水平和細胞水平上調控相關蛋白并激活細胞自噬,從而改善Vogt-小柳-原田綜合征。