多肽FRET熒光標(biāo)記技術(shù)
瀏覽次數(shù):1542 發(fā)布日期:2021-1-29
來(lái)源:肽谷生物官網(wǎng)
熒光標(biāo)記所依賴的化合物稱為熒光物質(zhì)。熒光物質(zhì)是指
具有共軛雙鍵體系化學(xué)結(jié)構(gòu)的化合物,受到紫外光或藍(lán)紫光照射時(shí),可激發(fā)成為激發(fā)態(tài),當(dāng)從激發(fā)態(tài)恢復(fù)基態(tài)時(shí),發(fā)出熒光。熒光標(biāo)記技術(shù)指
利用熒光物質(zhì)共價(jià)結(jié)合或物理吸附在所要研究分子的某個(gè)基團(tuán)上,利用它的熒光特性來(lái)提供被研究對(duì)象的信息。熒光標(biāo)記的無(wú)放射物污染,操作簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),使得熒光標(biāo)記物在許多研究領(lǐng)域的應(yīng)用日趨廣泛。人們利用熒光標(biāo)記的多肽來(lái)檢測(cè)目標(biāo)蛋白的活性,并將其發(fā)展的高通量活性篩選方法應(yīng)用于疾病治療靶點(diǎn)蛋白的藥物篩選和藥物開(kāi)發(fā)(例如,各種激酶、磷酸酶、肽酶等)。肽谷生物經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期開(kāi)發(fā),能夠提供技術(shù)成熟的各種熒光標(biāo)記多肽。
熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是一種非輻射能量躍遷,通過(guò)分子間的電偶極相互作用,將供體激發(fā)態(tài)能量轉(zhuǎn)移到受體激發(fā)態(tài)的過(guò)程。此過(guò)程沒(méi)有光子的參與,所以是非輻射的。該分析方法具有
快速、敏感和簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)。
用于FRET試驗(yàn)的染料是可以相同的。但在大多數(shù)應(yīng)用中其實(shí)是使用不同的染料。例如,一個(gè)供體基團(tuán)(EDANS)和接受基因(DABCYL)勻被連接到一HIV蛋白酶的天然底物上,當(dāng)該底物未被切斷時(shí),DABCYL可淬滅EDANS,從而檢測(cè)不到熒光。當(dāng)該底物被HIV-1蛋白酶切斷后,EDANS不再被DABCYL淬滅,隨即可檢測(cè)到EDANS熒光。蛋白酶抑制劑的有效性可憑借EDANS熒光強(qiáng)度的變化進(jìn)行監(jiān)測(cè)。
FRET肽是研究肽酶特異性的便利工具,由于其反應(yīng)過(guò)程可被連續(xù)監(jiān)測(cè),為酶活性的檢測(cè)提供了一個(gè)便捷的方法。供體/受體對(duì)的肽鍵水解后產(chǎn)生的熒光可衡量納摩爾級(jí)濃度的酶活性。當(dāng)FRET肽是完整的,表現(xiàn)出的是內(nèi)部的熒光猝滅,但當(dāng)供體/受體對(duì)的任何肽鍵斷裂就會(huì)釋放出熒光,此熒光可被連續(xù)檢測(cè),從而可對(duì)酶的活性進(jìn)行定量分析。FRET 肽可作為各類酶研究的合適底物,比如:肽酶、蛋白酶、激酶、磷酸酶的動(dòng)力特征和功能特征;對(duì)新的蛋白水解酶的篩選和檢測(cè);對(duì)多肽折疊的構(gòu)象研究等。
常用FRET的標(biāo)準(zhǔn)染料組合
Fluorescein and Dabcyl: |
FAM/Lys(Dabcyl) |
Fluorescein and Tamra: |
FAM/TAMRA |
Methoxy-coumarin-acetic-acid(MCA)
and 2,4-Dinitrophenyl(DNP): |
MCA/Lys(Dnp). |
Ortho-aminobenzoic acid (Abz)
and 2,4-dinitrophenyl (Dnp)
Abz/Tyr (NO2) or N-(2,4-dinitrophenyl)ethylenediamine (EDDnp): |
Abz/Tyr (NO2)
Abz/EDDnp |
Dabcyl and Glu(EDANS): |
Dabcyl/Glu(EDANS) |
FRET共振能量轉(zhuǎn)移引發(fā)熒光猝滅的激發(fā)與發(fā)射波
猝滅劑 |
熒光團(tuán) |
激發(fā)波(nm) |
發(fā)射波(nm) |
Dabcyl |
Edans |
336 |
490 |
Dansyl |
Trp |
336 |
350 |
DNP |
Trp |
328 |
350 |
DNP |
MCA |
328 |
393 |
DNP |
Abz |
328 |
420 |
Tyr (NO2) |
Abz |
320 |
420 |
常規(guī)RET供體(Donor)-接受(Aceptor)對(duì)的福斯特臨界距離(Forster Critical Distance)
供體(Donor) |
接受(Aceptor) |
福斯特臨界距離(nm) |
Tryptophan |
Dansyl |
2.1 |
IAEDANS (1) |
DDPM (2) |
2.5-2.9 |
BFP |
DsRFP |
3.1-3.3 |
Dansyl |
FITC |
3.3-4.1 |
Dansyl |
Octadecylrhodamine |
4.3 |
CFP |
GFP |
4.7-4.9 |
CF (3) |
Texas Red |
5.1 |
Fluorescein |
Tetramethylrhodamine |
4.9-5.5 |
Cy3 |
Cy5 |
5.0 |
GFP |
YFP |
5.5-5.7 |
BODIPY FL (4) |
BODIPY FL (4) |
5.7 |
Rhodamine 6G |
Malachite Green |
6.1 |
FITC |
Eosin Thiosemicarbazide |
6.1-6.4 |
B-Phycoerythrin |
Cy5 |
7.2 |
Cy5 |
Cy5.5 |
>8.0 |
(1): 5-(2-iodoacetylaminoethyl)aminonaphthalene-1-sulfonic acid
(2): N-(4-dimethylamino-3,5-dinitrophenyl) maleimide
(3): carboxyfluorescein succinimidyl ester
(4): 4,4-difluoro-4-bora-3a, 4a-diaza-s-indacene