蛋白質(zhì)印跡法 (免疫印跡試驗(yàn)) 即 Western Blot,其工作原理是經(jīng)過(guò) PAGE (根據(jù)分子大小) 分離的蛋白質(zhì)樣品,轉(zhuǎn)移到固相載體 (例如**纖維素薄膜) 上,然后將目的蛋白與特異性抗體進(jìn)行孵化。由于抗體只與目的蛋白結(jié)合,未結(jié)合的抗體被洗掉,只留下與目的蛋白結(jié)合的抗體。最后通過(guò)顯影檢測(cè)結(jié)合的抗體,條帶灰度與蛋白量相對(duì)應(yīng),因此可以反映蛋白質(zhì)的表達(dá)情況[1]。
WB 實(shí)驗(yàn)包括制樣、電泳、轉(zhuǎn)膜、孵育抗體和顯影等多個(gè)步驟(如圖 1),莫慌莫慌,小 M 帶你來(lái)一一化解。
圖 1. Western blot 的流程圖[2]
要想實(shí)驗(yàn)節(jié)奏穩(wěn),準(zhǔn)備工作那可要妥妥的——緩沖液配制。小 M 在此總結(jié)了 WB 實(shí)驗(yàn)中所涉及的各類(lèi)緩沖液的配方,拿走拿走別客氣~
表 1. Western blotting 各類(lèi)緩沖液配方
默默問(wèn)一句,看完這些配方,您倦了嗎?瘋狂計(jì)算,反復(fù)稱(chēng)量,您累了嗎?小 M 且在這里為您獻(xiàn)上 MCE 多種速溶顆粒產(chǎn)品 (可戳往期→讓“速溶顆粒”解放你的雙手),不用猶豫,省時(shí)省力,您且受累收好唄!
配好了溶液,就該輪到把樣品的蛋白分離出來(lái)了!那么樣品處理該注意什么呢?
低溫操作!低溫操作!低溫操作!重要的事說(shuō)三遍。為最大限度保證蛋白原有結(jié)構(gòu),所有涉及蛋白的操作都需在冰上進(jìn)行!
1. 細(xì)胞裂解液的制備。在冰上用預(yù)冷的 PBS 洗滌細(xì)胞。根據(jù)每 107 個(gè)細(xì)胞加 1 mL 裂解緩沖液的比例加入預(yù)冷的裂解緩沖液。細(xì)胞重懸液在 4 ℃ 下放置 5-10 分鐘,期間劇烈震蕩 3-4 次,每次 30 秒,實(shí)現(xiàn)充分裂解。放入離心機(jī)內(nèi),12,000 rpm 離心 13-15 分鐘。將上清液轉(zhuǎn)移到冰上預(yù)冷的離心管中,棄去沉淀。
如果是制備組織裂解液的話,解剖目標(biāo)組織一定要迅速,建議多次離心去除雜質(zhì)。
2. 蛋白樣本制備。取少量裂解液,通過(guò) BCA 法進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定。取出 50 μg 蛋白對(duì)應(yīng)的溶液至離心管中,加入 1×SDS 上樣緩沖液調(diào)平體積。將樣本緩沖液中的細(xì)胞裂解液在 100 ℃ 下煮沸 5-10 分鐘。
緊張又忙碌地制備完蛋白樣品,然后就是上樣和跑膠。(恰恰恰,跑個(gè)膠,先檢查下作業(yè)唄!) 首先是根據(jù)蛋白大小選擇合適的凝膠,參考下表 2。
然后將蛋白樣品上樣至 SDS-PAGE 凝膠孔中,記得在樣品旁邊的孔內(nèi)點(diǎn)上 marker。細(xì)胞裂解液或組織勻漿的總蛋白上樣量一般為 20-30 μg,電泳時(shí)長(zhǎng)一般 1.5 小時(shí),先用 80 V 跑 30分鐘,使各樣本處于同一水平,待 marker 開(kāi)始分離后將電壓調(diào)至 120 V 再跑 1小時(shí)。
表 2. 蛋白大小與推薦的凝膠百分比
順利到了轉(zhuǎn)膜這一步,已經(jīng)快完成實(shí)驗(yàn)啦~ 轉(zhuǎn)膜分為濕轉(zhuǎn)和半干轉(zhuǎn)兩種,轉(zhuǎn)膜時(shí)間應(yīng)根據(jù)蛋白大小進(jìn)行相應(yīng)調(diào)整。
濕轉(zhuǎn)是指轉(zhuǎn)印過(guò)程中凝膠和膜被浸入充滿(mǎn)轉(zhuǎn)印緩沖液的槽中,適用于大多數(shù)各種分子量的常規(guī)蛋白轉(zhuǎn)印。半干轉(zhuǎn)是指凝膠和膜被夾在預(yù)先潤(rùn)濕緩沖液的濾紙之間,濾紙與平板電極直接接觸。濕轉(zhuǎn)使用更廣泛,成本低;半干轉(zhuǎn)相對(duì)來(lái)說(shuō)更加節(jié)約時(shí)間,通常只需要 10 min 即可,具體時(shí)間視蛋白大小和儀器條件決定。不論是半干轉(zhuǎn)還是濕轉(zhuǎn),小 M 都有幾個(gè)共通小 tips 要給你:圖 2. 轉(zhuǎn)膜的物料順序:陰極,海綿 (濕轉(zhuǎn)需要),濾紙,膠,PVDF 膜,濾紙,海綿 (濕轉(zhuǎn)需要),陽(yáng)極[3]
相關(guān)產(chǎn)品 |
傳統(tǒng)的細(xì)胞、組織快速裂解液,適用于 Western Blot (WB)、免疫沉淀 (IP) 及免疫共沉淀 (Co-IP) 等實(shí)驗(yàn)。 |
磷酸酶抑制劑 Cocktail III (EDTA-Free, 10× in ddH2O) 是一種質(zhì)譜兼容的通用型蛋白和磷酸酶抑制劑 cocktail。 |
常用作 SDS-PAGE 緩沖液,也可用作 WB 緩沖液。 |
常用于 Western Blot 和 ELISA 的抗體封閉步驟,可在 15 分鐘內(nèi)完成封閉。 |
常用作 ELISA、Western Blot 等免疫分析實(shí)驗(yàn)中的洗滌緩沖液,也可用于抗體稀釋及封閉液的配制。 |
常用作免疫組化、原位雜交、酶聯(lián)免疫等實(shí)驗(yàn)中的洗滌緩沖液,也可用于抗體稀釋及封閉液的配制。 |
3-Color Prestained Protein Marker 分子量范圍為 10-190 kDa。 |
Ultra High Sensitivity ECL Kit 用于檢測(cè)辣根過(guò)氧化物酶(HRP)標(biāo)記的抗體及其關(guān)聯(lián)的抗原。 |
參考文獻(xiàn)
[1] Mahmood T, Yang PC, et al. Western blot: technique, theory, and trouble shooting. N Am J Med Sci. 2012 Sep;4(9):429-34.
[2] Meftahi, GH, Bahari, Z, Zarei Mahmoudabadi, A, Iman, M, Jangravi, Z , et al. Applications of western blot technique: From bench to bedside. Biochem Mol Biol Educ. 2021; 49: 509– 517.
[3] Wenying Pan, Wei Chen, and Xingyu Jiang, et al. Analytical Chemistry 2010 82 (10), 3974-3976