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234 次利用染色質(zhì)免疫共沉淀測序技術(shù)ChIP-seq等揭示頭頸鱗癌免疫逃逸機制 2024-10-9
免疫逃逸是癌癥進展的關(guān)鍵里程碑，是腫瘤免疫治療的理論基礎(chǔ)。頭頸部鱗狀細胞癌（(head and neck squamous cell carcinoma, HNSCC)）是全球最常見的惡性腫瘤之一，傳統(tǒng)治療選擇包括手術(shù)切除、放
517 次 ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1軸在疾病進展中的表觀調(diào)控作用 2024-8-27
大家好，這里是專注表觀組學(xué)十余年，領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一種慢性肝臟疾病，其特征是肝臟中脂肪積累、炎癥和纖維化。干擾
369 次 seq-DAP-seq和ChIP-seq聯(lián)合檢測揭示花發(fā)育器官轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控機制 2024-6-28
技術(shù)簡介MADS轉(zhuǎn)錄因子的同源蛋白SEPALLATA3 (SEP3)和AGAMOUS (AG)是調(diào)控擬南芥花發(fā)育分化的重要DNA結(jié)合蛋白。在雌蕊發(fā)育階段，SEP3和AG形成異源四聚體，通過識別CArG-box序列來調(diào)控基因的表達。
628 次 ChIP-seq等在揭示m6A修飾以促進卵巢癌發(fā)展研究中的應(yīng)用 2024-2-29
卵巢癌（Ovarian cancer，OC）是影響女性生殖系統(tǒng)的三種常見惡性腫瘤之一。轉(zhuǎn)錄因子Forkhead box蛋白O1（FoxO1），又稱forkhead橫紋肌肉瘤（rhabdomyosarcoma）轉(zhuǎn)錄因子，屬于Forkhead box O（F
459 次 ChIP-seq等揭示人畜共患寄生蟲弓形蟲的蛋白質(zhì)乳酸化和代謝調(diào)控機制 2024-1-29
弓形蟲（Toxoplasma gondii）是弓形蟲�。╰oxoplasmosis）廣泛傳播的寄生蟲病的病原體之一，但其生物學(xué)特性仍然知之甚少。乳酸（Lactate）作為葡萄糖代謝的產(chǎn)物，不僅在包括弓形蟲在內(nèi)的多種生物
465 次文獻解讀：WWOX基因通過上調(diào)Myc促進骨肉瘤發(fā)生發(fā)展的表觀調(diào)控機制 2024-1-10
骨肉瘤（Osteosarcoma, OS）是一種高侵襲性骨腫瘤，主要影響兒童和青少年。這種惡性腫瘤與不良臨床結(jié)果相關(guān)，尤其是肺轉(zhuǎn)移。由于其罕見性和生物學(xué)異質(zhì)性，對其分子基礎(chǔ)研究有限，阻礙了有效療法
391 次 ChIP-seq等揭示SETD2介導(dǎo)H3K36me3調(diào)控結(jié)直腸癌進展的表觀遺傳機制 2023-12-5
結(jié)直腸癌(Colorectal cancer，CRC)是一種復(fù)雜的多階段疾病，由基因突變和表觀遺傳改變相互作用引起。組蛋白H3K36三甲基轉(zhuǎn)移酶SET結(jié)構(gòu)域2 (SETD2)是一種表觀遺傳信號分子，在結(jié)直腸癌中突變率為5
391 次 ChIP-seq揭示BRWD3調(diào)控KDM5活性以維持H3K4甲基化水平的表觀機制應(yīng)用 2023-10-31
組蛋白修飾對調(diào)控染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達至關(guān)重要，組蛋白修飾失調(diào)可能導(dǎo)致疾病狀態(tài)和癌癥。染色質(zhì)結(jié)合蛋白BRWD3（Bromodomain and WD repeat-containing protein 3）是Cul4-DDB1 E3泛素連接酶復(fù)合
424 次 ChIP-seq等在揭示Runx2通過轉(zhuǎn)錄調(diào)控表達激活肝星狀細胞中的應(yīng)用 2023-8-31
肌成纖維細胞（myofibroblasts）主要由肝臟中活化的肝星狀細胞(hepatic stellate cells HSC)組成，在肝纖維化進展中發(fā)揮著核心作用。由于肌成纖維細胞主要負責(zé)細胞外基質(zhì)蛋白的合成、沉積和重塑
367 次 ChIP-seq等在揭示NRF1促進原始生殖細胞的發(fā)育、增殖和存活中的應(yīng)用 2023-8-14
大家好，這里是專注表觀組學(xué)十余年，領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。原始生殖細胞（Primordial germ cell，PGC）是生殖細胞前體，可以產(chǎn)生卵母細胞和精子，確保生命延續(xù)。盡管PGC特化（PGC specif
368 次 ChIP-seq等揭示H3K4me1修飾在蜜蜂級型分化中的表觀遺傳調(diào)控機制 2023-7-18
蜜蜂是一種真社會性昆蟲，是研究社會性昆蟲級型發(fā)育和級型分化的重要模式生物，其分工主要基于級型分化（蜂王(queen)和工蜂(worker)）。分化后，盡管基因組相同，但蜂王和工蜂具有不同的形態(tài)、生
600 次染色質(zhì)免疫共沉淀測序ChIP-seq研究成果匯總及DNA-蛋白質(zhì)互作研究思路 2023-6-26
在生物學(xué)研究中，DNA與蛋白質(zhì)之間的互作（DNA-Protein Interactions，DPIs）是至關(guān)重要的，參與基因的表達、調(diào)控、復(fù)制、重組和修復(fù)以及RNA的轉(zhuǎn)運、翻譯和調(diào)控等多個過程，幾乎涉及所有的生命活
558 次 ChIP-seq等揭示METTL14調(diào)控哺乳動物二價結(jié)構(gòu)域的表觀遺傳機制 2023-6-20
大家好，這里是專注表觀組學(xué)十余年，領(lǐng)跑多組學(xué)科研服務(wù)的易基因。組蛋白及其翻譯后修飾在調(diào)控基因表達和其他染色質(zhì)模板化過程中起著重要作用。組蛋白H3賴氨酸4三甲基化（H3K4me3）和組蛋白H3K2
456 次細菌ChIP-seq測序分析在抗生素合成機制研究新進展中的應(yīng)用 2023-6-12
2023年06月07日，華東理工大學(xué)生物工程學(xué)院和生物反應(yīng)器工程國家重點實驗室葉邦策教授和尤迪副教授為共同通訊作者、博士生符瑜為第一作者以“A meet-up of acetyl phosphate and c-di-GMP
641 次全基因組ChIP-seq分析揭示細菌轉(zhuǎn)錄因子PhoB的基因內(nèi)結(jié)合位點 2023-5-30
細菌編碼許多轉(zhuǎn)錄因子（transcription factor，TF），這些轉(zhuǎn)錄因子通過與啟動子周圍的DNA結(jié)合并調(diào)控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結(jié)合啟動子DNA或異構(gòu)化為主動轉(zhuǎn)錄構(gòu)象的能力來調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄起始。目前對T
635 次 ChIP-seq等揭示熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b調(diào)控植物高溫脅迫響應(yīng)的分子機制 2023-4-24
在擬南芥中，熱休克轉(zhuǎn)錄因子A1b（HEAT SHOCK TRANSCRIPTION FACTORA1b，HSFA1b）通過影響種子產(chǎn)量來調(diào)控對環(huán)境脅迫的抗性。HSFA1b是生殖適應(yīng)性的決定性因素，這種調(diào)控機制怎么形成的呢？2018年，
631 次高通量測序后的下游實驗驗證方法之ChIP-seq介紹 2023-3-28
此前，我們分享了染色質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP-seq）的數(shù)據(jù)挖掘思路，進而篩選出TF結(jié)合/組蛋白修飾的目標(biāo)區(qū)域和候選靶基因。做完ChIP-seq測序后，如果需要對分析結(jié)果中感興趣的內(nèi)容進行后期驗證，
971 次染色質(zhì)免疫共沉淀測序(ChIP-seq）的數(shù)據(jù)挖掘思路 2023-3-27
CHIP-seq研究的數(shù)據(jù)挖掘思路主要分為3步：1. 整體把握CHIP-seq圖譜特征：peak/reads在基因組上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距離TSS位點的距離分
741 次 ChIP-seq(組蛋白)揭示H3K36me修飾影響溫度誘導(dǎo)的植物可變剪接和開花 2023-2-22
2017年，荷蘭瓦格寧根大學(xué)分子實驗室RGH Immink團隊以“Histone H3 lysine 36 methylation affects temperature-induced alternative splicing and flowering in plants”在《Genome
2663 次定量分析ChIP-qPCR數(shù)據(jù)的方法：Percent Input法和富集倍數(shù)法步驟介紹 2023-2-22
ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)需要針對可變性來源進行標(biāo)準(zhǔn)化，包括染色質(zhì)數(shù)量、免疫沉淀的效率（富集效率）和 DNA 回收率。兩種常用的標(biāo)準(zhǔn)化 ChIP-qPCR 數(shù)據(jù)方法——Percent Input法和富集倍數(shù)法（F

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