微生物鑒定服務——真菌18S rDNA/ITS鑒定
詳細描述:
傳統(tǒng)的真菌分類鑒定主要是按照真菌的形態(tài)、生長以及生理生化等特征對真菌進行分類。然而真菌的種類繁多,個體多態(tài)性明顯,而且其生長、生理生化特征也會隨著環(huán)境的變化而不穩(wěn)定。因此,采用傳統(tǒng)的方法對真菌進行正確的分類存在較大的困難。隨著分子生物學技術(shù)的發(fā)展,核酸序列分析已被廣泛的應用于真菌分類鑒定中,目前常用的技術(shù)包括18S rDNA、ITS(Internal Transcribed Spacer,ITS)及18S rDNA-ITS序列分析技術(shù)。
18S rDNA是編碼真核生物核糖體小亞基rRNA(18S rRNA)的DNA序列,序列中既有保守區(qū)又有可變區(qū),保守序列區(qū)域反映了生物物種間的親緣關(guān)系,而高變序列區(qū)域則能體現(xiàn)物種間的差異。由于18S rDNA在進化速率上比較保守,因此在系統(tǒng)發(fā)育研究中較適用于種級以上階元的分類。內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)ITS位于核糖體rDNA 18S、5.8S及28S之間,由于不需要加入成熟核糖體,因此在進化過程中能夠承受更多的變異,其進化速率為18S rDNA的10倍,屬于中度保守的區(qū)域,利用它可研究種及種以下的分類階元。另外,也可通過選擇引物同時擴增18 S rDNA和ITS,通過分析18 S rDNA序列,先在較高級別上確定樣品的歸屬,然后根據(jù)ITS 序列,將真菌歸類到種或亞種水平。
提供結(jié)果
1. 結(jié)題報告,包括實驗流程,PCR產(chǎn)物電泳圖、進化樹結(jié)果等
2. 測序峰圖文件
3. 序列文件
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